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  • 为什么call peak的时候RYBP用的q值是0.01而其他样本都用的0.05,这是RYBP没有peak的原因吗?

    ChIP-seq基础入门

    理解ChIP-Seq 到了目前这个水平,我学习新的高通量数据分析流程时已经不再考虑代码应该如何写的问题了。我更多要去考虑一个技术的目的和意义。 转录组主要研究的问题是基因在不...

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    ChIP-seq基础入门

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  • RNA-seq,Ribo-seq数据分析(上)

    文献:The Tomato Translational Landscape Revealed by Transcriptome Assembly and Ribosome P...

  • 全基因组关联分析流程

    按照前人的教程,跑了跑GWAS流程,作为初学者,欢迎大家提问,指教。 数据来源:A new regulator of seed size control in Arabido...

  • 请教一下师兄,提取172个样本之后有些位点出现的MAF=0,是不是就是说,在大群体中该位点有变异而对于这个172样本的群体而言这个位点没有变异?

    重复一篇文献的GWAS(一):基因型数据整理

    文献:A new regulator of seed size control in Arabidopsis identified by a genome-wide asso...

  • RNA-seq中基因表达表达定量单位选择

    做RNA-seq可以比较不同样本之间基因表达水平的差异,那么如何衡量基因的表达水平呢? 最简单的方法是,直接比较mapping到某一个基因的reads数目。但是这种做法有不足...