1. 前言 构建一棵系统发育树是研究系统学和进化的基础。然而,发育树的构建是对分类单元进化历史的推测,因此对发育树的可靠性检验也是重中之重。一棵发育树的获得大致分为数据输入、...
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1. 前言 构建一棵系统发育树是研究系统学和进化的基础。然而,发育树的构建是对分类单元进化历史的推测,因此对发育树的可靠性检验也是重中之重。一棵发育树的获得大致分为数据输入、...
本篇文章是为了记录本人在系统发育实验和数据分析过程中,所使用过的以及部分未使用但如雷贯耳的软件的集合。当然,相对于整个系统发育软件之汪洋大海,此处不过一滴水! 1. 数据获取...
更新:20190319 使用EasyCodeML完成dnds的计算,自己尝试了分支模型和位点模型的计算,简直不要太容易! 更新:20190314 教程 http://wiki...
防杠叠甲:下述所有内容均为本人理解,欢迎友好的学术讨论。觉得看不进去的,写的不好的请windows用户移步右上角×标记,mac用户移步左上角,手机用户请关机。 持续更新中 将...
许多基因组的文章里都会提到使用PAML进行基因的正选择分析(positive selection), 网上也有一些教程介绍如何用PAML进行分析。无论是文章,还是教程,大多只...