RNAseq的第二步就是Aligment, 一般都是有参考基因组的比对,据同事介绍,比对这一步,比对率再80%以上才算是正常的,很多样本的比对结果都能达到90%以上。 然而,...
作为一名流程TD,这两个概念非常重要。但是在平常的交流中,我发现很多朋友对这两个概念还是比较模糊的。而且纵使是大佬们之间的理解也或多或少的存在差别。 为了统一这些重要的基本概...
ggpubr: 'ggplot2' Based Publication Ready Plots 一款基于ggplot2的可视化包ggpubr,能够一行命令绘制出符合出版物要求...
参考生信技能树1以及生信技能树2只记录从数据下载,到最终结果展示,具体生物学知识请自行查阅稍后关于ChIP-seq的背景知识我会再发布一篇文章。数据下载:数据存放地址关于环境...
============================================写在前面:可以参考另外一篇《得到差异基因后怎么做?[https://www.jians...
写在前面 这两三天,chatGPT 似乎是活了一把。不过大家来来去去都是玩一玩。一开始可能觉得有趣,但这个跟玩游戏一样,过去了就是过去了。我想试试看是否有一些不一样。比如,我...
RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析 原文链接:RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析-生物知识学习 (biotechknowledgestudy.com)...
单细胞转录组数据分析系列教程 sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...
刘小泽写于18.7.18表型与基因型相关联(基因定位)是遗传学上的重要问题。 什么是重测序Resequencing? 我们使用的基因组是怎么来的?通过Denovo测序,也就是...
Tajima's D - Wikipedia[https://en.wikipedia.org/wiki/Tajima%27s_D] Tajima's D是由日本研究员田田文...
这周二组会期间。导师提起要将实验室所有构建的载体在Geneious里面统一管理。然后顺便问了一句是不是大家都会使用Geneious进行载体构建。然后提了一句,总不会有人的载体...
实验方法 1.取一定的植物叶片组织,用液氮研磨成粉末装,加入65℃预热的TPS DNA 提取液600ul,充分混匀。2.65℃水浴30min,期间颠倒混匀3-4次。3.加入氯...