1 什么是motif分析 在DNA或蛋白的同源序列中,不同位点的保守程度是不一样的,一般来说,对DNA或蛋白质功能和结构影响比较大的位点会比较保守,其它位点则不是很保守。这些...
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1 Bedtools:一个强大的基因组算法工具集 Bedtools是由犹他大学昆兰实验室开发的基因组算法工具集,它堪称是基因组分析工具中的瑞士军刀。Bedtools可以对基因...
今天看了莫言《晚熟的人》 作家莫言在《晚熟的人》一书中,曾说过这样一段话:本性善良的人都晚熟,他们不是想成熟,而是被恶人催熟的,后面虽然开窍了,但仍然保持一片赤诚。他们不断地...
我们先来用专业的术语描述一下awk是什么,如果你看不懂,没关系,我们会再用"大白话"解释一遍。 awk是一个报告生成器,它拥有强大的文本格式化的能力,这就是专业的说法。 你可...
基因组组装完成之后,就需要对最后的质量进行评估。我们希望得到的contig文件中,每个contig都能足够的长,能够有一个完整的基因结构,归纳一下就是3C原则: 连续性(Co...
GC bias describes the relationship between GC content and read coverage across a genome...
提起 LTR,相信很多人和我之前一样都是熟悉又陌生的感觉,听过或者接触过却未深入了解过。若您对 LTR 分析有兴趣,却苦于无从下手时,愿本文作为一个叩门砖,为您敲开 LTR ...
1.UCSC上重复区域文件rmsk.txt.gz 将rmsk文件根据重复序列分类需求转换为bed文件:grep LINE rmsk.txt | awk -F"\t" '{pr...
Basic local alignment search tool (BLAST) 包括:blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等....