分割数据框df[df['column_name']==""]kk = pd.DataFrame({'aa': ['A', 'B', 'A', 'C', 'B', 'A', '...
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IP属地：上海
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DataFrame: 分割 + 合并
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CellBender: 去除 RNA 污染1. PaperUnsupervised removal of systematic background noise from droplet-based single-c...
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DataFrame: 取一列
依靠列名对 DataFrame 中的某一列进行提取kk = np.arange(1, 13).reshape(3,4)kk=pd.DataFrame(kk)kk.column...
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List: 内置 list
可以用 string 模块导入一些内置 list>>> import string>>> kk=list(string.ascii_lowercase) '#内置小写...
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Scanpy: .var
AnnData.varstore the metadata of genes (features) Data type:>>> type(scanpy_object_used...
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Scanpy: .obsAnnData.obsstore the metadata of cells (barcodes) Data type:>>> type(scanpy_object_used...
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DataFrame: 删除一列从 df 中删除一列并返回此列的数值df.pop('column_name')Note: .pop() 每次只能删除一列 示例一import pandas as pddf =...
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DataFrame: 获得唯一值
获得所有行组合的唯一值df.drop_duplicates() kk=pd.DataFrame({'aa':[1,1,2,2,3,3],'bb':[1,1,2,2,3,4]}...
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DataFrame: 行名 + 列名查看 列名 和 行名kk=np.arange(1,13).reshape(3,4)kk=pd.DataFrame(kk)kk.columns=["aa","bb","cc",...
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DataFrame: 创建依赖 array，创建新的全是空值的 DataFramekk = pd.DataFrame(index=range(3), columns=range(4)) '#创...
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List: 构建重复型 list
np.repeat()https://numpy.org/doc/stable/reference/generated/numpy.repeat.html#numpy-rep...
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Scanpy: 保存图片
Save plot as SVG, PDF or PNG import scanpy as scimport matplotlib.pyplot as pltsc.pl.vi...
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DataFrame: 对列数据进行统计.describe()对数值型数据进行描述性统计 (mean, sd, 25% ...)kk=np.arange(1,41).reshape(8,5)kk=pd.DataFr...
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Scanpy: read and write data
read data sc.read_10x_h5() sc.read_10x_mtx() sc.read_h5ad("path/object_name.h5ad")读取 .h...
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Scanpy: .uns + .obsm + .varm.uns用来存放未分类的数据 data type:>>> type(scanpy_object.uns)collections.OrderedDict 提取数据:>>> kk...
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Scanpy: merge data sets
sc.concat()https://anndata.readthedocs.io/en/stable/generated/anndata.concat.html#annda...
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Python: 合并列表
list_3 = list_1 + list_2直接使用 + 合并 两个列表 为 一个列表 kk=["aa", "bb"]pp=["cc", "dd"]ff=kk+ppdis...
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Python: 字符串拼接
.join()间隔为 _ 的拼接kk=["aa"]pp=["cc"]cc="_".join(kk+pp)print(cc)aa_cc间隔为 空格 的拼接kk=["aa"]pp...
