知识背景 广义线性混合模型可以看做是广义线性模型（GLM）以及线性混合模型(LMM)的扩展，为了更好地理解GLMM，肯定要对普通线性模型、广义线性模型以及线性混合模型有个理解...
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广义线性混合模型（GLMM）
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系统发育基础知识介绍
系统发育学概念 系统发生（或种系发生、系统发育，phylogeny）是指生物形成或进化的历史。系统发生学(phylogenetics)研究物种之间的进化关系，其基本思想是比较...
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SAS用数组的方式查找缺失值在SAS中，数组的一般形式为： 其中： array是定义数组的标志； 数组名的命名规则与SAS数据集名一样； 下标指定数组中包含的元素个数，这里的元素一般就是变量，可以使用“...
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SAS数据的对比和清洗数据的对比 SAS中对比两个数据集的命令是proc compare，它的基本格式如下： 其中，proc compare语句是调用数据比较过程，选项base和compare分别...
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PH525 series - Discovering Batch Effects with EDA本章节的主要内容是如何使用探索性数据分析（EDA）检测批次效应，使用的示例数据依旧是基因表达数据。 数据准备 从上图中我们可以看到，男性女性的区别是很明显的，所以我们可以通过...
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Microbial trend analysis介绍 2020年1月31日METHODOLOGY上线了一篇文章《Microbial trend analysis for common dynamictrend, group...
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PH525x series - Simpson’s Paradoxbatch effect（批次效应） 在高通量研究中，常常被忽略的一个问题就是批次效应，简单的说，批次效应就是由实验条件、试剂批次和实验人员等等因素的不同，而造成试验出现误差...
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PH525x series - Class Prediction本文的题目是class prediction（分类预测），其实就是机器学习，这两个词可以互相替代着使用。而本章呢，其实就是对机器学习进行一个简单的介绍，如果你想深入学习，作者...