Ai基因测序

NCBI中常用到的数据功能：1.下载参考基因组 2.下载相关测序数据，构建进化树 1.下载参考基因组 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/dataset...

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大家肯定都听说过新冠病毒分型，像什么包括阿尔法、贝塔、德尔塔、奥密克戎变异株BA.2.12和BA.2.12.1。。。。这些分型是怎么来的？ 基因组序列的差异通过比对不同病毒株...

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Nextflow Nextflow 由 Paolo Di Tommaso 于 2013 年开发，他是一位计算生物学家和软件工程师。当时 Paolo Di Tommaso 在巴...

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docker相较于conda做生信分析有很多优势，尤其是在生信流程的搭建，多系统的支持移植性。但Docker学习难度有点高，需要花时间来学习。对于小白来说，初次安装肯定是很困...

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很多人肯定很苦恼，自己的电脑是window系统，很多生信软件不支持window系统，这种情况下只能利用虚拟机装一个完整的Linux系统，虚拟机又很吃系统资源，今天给大家介绍一...

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1. 什么是Linux操作系统？ Linux是一种开源的操作系统，最初由Linus Torvalds于1991年发布。与其他操作系统（如Windows和macOS）不同，Li...

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思路 第一步你们的核苷酸有多相似（初步判断） 拿到病原微生物基因测序的结果,先从宏观上可以看一下他们的相似性--盲人摸象，给了你一个大肠杆菌的基因组和一个金黄色葡萄球菌的基因...

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最近有点忙，更新的较少 今天主要介绍霍乱弧菌基本特点以及基因结构以及NGS测序后续分析方法 先看下霍乱弧菌的生物学分类： 域（Domain）：细菌域（Bacteria） 界（...

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阪崎肠杆菌（Enterobacter sakazakii），是一种革兰氏阴性无芽胞杆菌，属于肠杆菌科。周生鞭毛、有动力、兼性厌，产黄色色素 (大家一定要理解生物学分类界门纲目...

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接着上一个视屏讲，很多人说代码的输出结果看不懂，今天详细聊一下 今天选择了11个沙门菌进行聚类分析，最终构建进化树 聚类(Cluster)分析顾名思义就是指将研究的对象进行分...

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人工智能在代码编写方面已经有很大的编写能力，我就把自己的一些使用分享给大家（chatgpt使用需要tizi，最后放了chatgpt镜像） 推荐大家使用kimi(国产的人工智能...

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号外！！！ 在这周我会推出实战用snippy构建系统进化树的视频，我会拿出11个沙门菌进行聚类分析！！！！！！！！！ vcf （Variant Call Format）是一种...

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1.参考基因组,基因注释之间的关系 参考基因组是指完成了测序和组装的完整基因组序列,常写在fasta文件中(后面我们聚类分析需要用到参考基因组) 但这些fasta文件简直就是...

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chatgpt回答为什么要对denovo组装结果进行质控的回答： 基因denovo组装完成后进行质控（质量控制）是非常重要的一步，其原因主要包括以下几个方面： 确保组装的准确...

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如何获知基因序列属于哪个物种，这个很简单，难的是如何去将这个世界上所有已知的生物分类，以及去构建生物数据库。当数据库构建好之后我们去比对就好了。 先来谈一谈物种分类 分类阶元...

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下机得到原始fastq文件。经过fastp软件处理得到质量相对较高的cleandata,之后再使用kraken2进行物种注释。 1.如何完全去除人源序列 上一篇文章中讲到去除...

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核酸抽提是基因测序流程中至关重要的步骤。高质量的核酸样本是确保测序准确性和可靠性的基础。以下是核酸抽提对基因测序的重要性： （看的人多了我就能喝杯咖啡了 微信公众号同名） 纯...