1.默认安装v4版本 2.因为有个去批次的R包（iSMNN）需要安装V3版本的Seurat，所以我需要安装Seurat v3版本但是在此过程中一直在报错： 发现只有spats...
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Seurat v3版本安装
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单细胞ChIP-seq方法的比较写在前面的废话 这篇文章来自于一个舔狗的悲哀，谨以此文告诉大家莫当舔狗…… 以上聊天记录，就是整个故事背景。当时我的内心历程： 我看过类似的文章欸，赶紧发出来展现一下我的阅读...
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centos7非root安装各种依赖库(举一反三)在安装cytoTRACE的时候，除了之前所需要的更高版本的GCC，此外，它还需要nc-config这个依赖库，这在我们组服务器也是没有的，在没有root权限下，我们该如何安装...
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R语言中如何在Mac下快速下载和安装包
一.安装R包的方式： 由于R包发布在cran上的包非常严格所以很多功能强大的包并不能直接在cran上下载到--也就是说用 install.package 命令无法下载，这是后...
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2020-03-20 人心脏发育过程中全器官的基因表达和细胞图谱一句话总结：利用空间转录方法在单细胞分辨率下探索人类心脏发育的基因表达图景，以构建一个3D器官范围的图谱。 Highlights Profiled spatiotempora...
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SingleR辅助注释单细胞很多做单细胞的研究者都提出过这个问题，是否有直接的功能能对单细胞直接进行注释，而不是繁琐的参看文献，搜索marker，人为对单细胞进行注释。单细胞真的可以实现自动化注释吗？我...
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单细胞转录组功能分析（超详细clusterProfiler,GSEA,GSVA分析）单细胞分析不可避免的会涉及到鉴定不同细胞类型的功能或比较相同类型在不同状态下的功能差异，因此，功能分析在单细胞分析中相当重要. 功能分析的方法很多，这儿我们主要讲述3种功能分...
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2020-08-28 SingleR v1.2.4单细胞自动注释软件首先SingleR属于不基于Prior Knowledge的注释方法；相对应的还有基于Prior Knowledge的方法，比如CellAssign，但两个用起来都不是很顺手...
