https://www.jianshu.com/p/19241ae1b77a[https://www.jianshu.com/p/19241ae1b77a] 一、参考文档 h...
发简信
IP属地：湖南
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生信常用数据库（一）：interproscan数据库搭建
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利用snpEff对snp vcf 信息进行注释
利用snpEff软件可以对获得的snp信息进行注释，以确定该snp对于基因编码信息的影响：同义替换、非同义替换、非编码区等等 首先查看snpeff.config 文件中有无自...
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Conda 以及 Snakemake 安装及使用防止自己下次忘了，作为笔记使用，整理自网络。参考自Snakemake：简单好用的生信流程搭建工具 | | 百迈客生物 (biomarker.com.cn)[http://ww...
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featureCounts 统计BAM文件中每个基因匹配的reads数
Subread package: high-performance read alignment, quantification and mutation discovery...
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根据Eggnog注释信息构建orgDb数据库并进行GO、KEGG分析
本文大部分内容来源于网络，写此文章仅是为了自己后面查找方便，如有侵权，联系删除。参考来自于：自己构建物种包OrgDb，然后用clusterProfiler富集分析 - 简书 ...
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DESeq2+clusterProfiler使用流程（以玉米B73_v3数据为例）
DESeq2+clusterProfiler使用 读取featureCounts的reads统计结果，存储与countData矩阵中 设置样品信息列表 计算不同样品间的重复一...
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GWAS全基因组关联分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程，并提供了基本的命令，用到的软件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等，在此分享出来...
