发简信
IP属地：新疆
-
将ENA下载的MD5值转化成md5sum可以识别的格式
本脚本可以将从ENA下载的MD5文件（如下） 转化成md5sum 可以识别的格式 代码如下
-
featureCounts 统计BAM文件中每个基因匹配的reads数
Subread package: high-performance read alignment, quantification and mut...
-
Conda 以及 Snakemake 安装及使用防止自己下次忘了，作为笔记使用，整理自网络。参考自Snakemake：简单好用的生信流程搭建工具 | | 百迈客生物 (biomarker.co...
-
根据Eggnog注释信息构建orgDb数据库并进行GO、KEGG分析
本文大部分内容来源于网络，写此文章仅是为了自己后面查找方便，如有侵权，联系删除。参考来自于：自己构建物种包OrgDb，然后用clusterPro...
-
DESeq2+clusterProfiler使用流程（以玉米B73_v3数据为例）
DESeq2+clusterProfiler使用 读取featureCounts的reads统计结果，存储与countData矩阵中 设置样品信...
-
利用snpEff对snp vcf 信息进行注释
利用snpEff软件可以对获得的snp信息进行注释，以确定该snp对于基因编码信息的影响：同义替换、非同义替换、非编码区等等 首先查看snpef...
-
利用MMAPPR进行BSR分析流程
1. 安装软件 1.1. 下载安装MMAPPR 1.2. 下载安装USeq软件 2. 构建参考基因组索引 该索引用于后面Hisat2比对 3. ...