已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体,又如R包chromoMap,IdeoViz,karyploteR,ggbio和在线工具Idiographica,虽然能绘制直的...
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Augustus是一个使用频率很高的程序,但是安装却麻烦的一批,而且说明书对新手也很不友好; 网上倒是有很多安装的解答,可能是每个机子的情况不太一样,没有一个讲的比较全面的,...
NCBI-SRA和EBI-ENA数据库 SRA数据库: Sequence Read Archive:隶属NCBI (National Center for Biotechno...
FALCON和Canu的组装后会得到一个单倍型融合的基因组,用来表示二倍体基因组。之后,FALCON Unzip和Supernova这类软件进一步处理其中等位基因区域,将这部...
准备训练集和测试集 根据Augutus的官方教程,可靠的基因结构序列的要求如下: 提供基因的编码部分,包含上游几KB。通常而言,基因越多,效果越好,至少准备200个基因以上。...
BUSCO - 组装质量评估软件 BUSCO - Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs 额。直译的话就是普遍通用的单拷贝直...