请问，会存在最长转录本长度不等于gene长度的情况嘛
如果存在，怎么从gff提取最长转录本
2021-07-04史上最暴力提取转录本和基因长度（基于shell命令行）在count矩阵转化成TPM或者fpkm矩阵时会用到基因或者转录本长度进行均一化处理，那基因和转录本长度具体怎么计算那，写脚本有困难？龙哥，教你史上最简单，傻瓜操作！ 1.基...
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学习《云雨图》看Y叔的公众号发现一个有意思的箱线图展示，赶紧来学习一下：https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI5NjUyNzkxMg==&mid=2247...
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探针寻找之旅（8）——RIdeogram绘制染色体探针分布图
安装 linux服务器都装不上，净是问题，在自己win10的电脑上装的很是顺利！> BiocManager::install("RIdeogram") 准备输入文件 kary...
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生信 | Circos实战写在前面 由于circos官网的教程太全面了，虽然好但反而感觉比较复杂，难易上手，因此我将他们精简了一下。由于官网的教程中包含的数据太杂了，所以我精简了数据与代码放到了扣扣群...
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生信 | circos文件准备大全（以拟南芥为例）一、写在前面 扣扣群：559758504（目前无需验证，一键即可加入） 如果你不想学，老板又催着要，你可以加群私聊我寻求帮助( $ _ $ )，但还是自己学，知识都是自己的。...
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解决 Stringtie 基因重复定量的意外收获说明：因为平台限制和平台广告等原因，今后的文章将不在简书更新，请移步并订阅个人博客 说明：因为平台限制和平台广告等原因，今后的文章将不在简书更新，请移步并订阅个人博客 说明：...
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hisat2+stringtie+deseq2分析RNA-SEQ数据
hisat2+stringtie for ((i=2064449;i<2064457;i++)); do hisat2 -p 2 --dta -x ~/RNASEQ/inde...
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我是穿蓬蓬裙的小公举。
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啦啦啦，每天睡到自然醒吧
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bismark_methylkit_awk
目标：图1-> 图2: # 解压 gunzipxxx.CpG_report.txt.gz # awk： awk ' { if ( $4+$5!=0 && $3~/+/) pr...
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简书是我在学习别人东西的过程中记笔记的地方，以便自己不断查阅复习，同时通过不断的输出来暴露自己的短处从而不断的进步。大家留言问的问题我都看到了，没有回复是因为自己学艺不精不能准确答复，望谅解~
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
