请一定看这里：写下来只是为了记录一些自己的实践，当然如果能对你有所帮助那就更好了，欢迎大家和我交流 差异分析流程: 1 初始数据 2 标准化(normalization)：D...
IP属地：内蒙古
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RNA-seq摸索：4. edgeR/limma/DESeq2差异基因分析→ggplot2作火山图→biomaRt转换ID并注释 -
生信 | circos文件准备大全（以拟南芥为例）一、写在前面 扣扣群：559758504（目前无需验证，一键即可加入） 如果你不想学，老板又催着要，你可以加群私聊我寻求帮助( $ _ $ )，但还是自己学，知识都是自己的。...
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「2022-01-04更新」HiC软件安装篇之Lachesis2022-01-04 update: 更新了一些错误集锦 Lachesis是希腊神话众神之一，负责决定生命之线的长度。但是咱们这个lachesis是2013年发表在natur...
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从0开始的RNA-seq教程
本次RNA-seq分析目标明确，得到基因的表达矩阵即可，不涉及其他分析。 样本：植物的叶和茎的转录组；测序方法：双端测序；有参考基因组文件 1.数据质控拿到测序数据，第一步进...
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Linux Sort 按照某一列排序
转载：https://segmentfault.com/a/1190000005713784sort是在Linux里非常常用的一个命令，管排序 sort将文件的每一行作为一个...
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Jalview使用方法（1）——多序列比对今天我们介绍一款全平台可以使用的多序列比对工具，那就是Jalview，它的功能非常强大，但是我们今天讲解最基本的多序列比对及结果输出。 1. 导入序列 你可以导入你的fast...
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无参转录组序列组装 — Trinity转录组分析策略 转录组分析策略根据有无参考转录组可以分为两类： 有参比对—定量—差异分析—功能富集分析等 无参组装—定量—差异分析—功能富集分析等image 无参考转录组序列...
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RNA-seq从入门到自闭（Trimmomatic和Fastp）抱歉拖了这么久，主要是最后分析出来的数据跟某平台对比后发现差了很多。无法解释这个结果。用了几个软件测试，最后的结果都跟之前平台的Exp结果对不上。最后猜测可能还是这套数据有问...
