GO富集介绍每个基因都会对应有一个或多个GO term(也就是GO功能)。富集涉及到两个概念:前景基因和背景基因。前景基因就是你关注的要重点研究的基因集,背景基因就是所有的基...
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欢迎关注”生信修炼手册”! Gene Ontology是研究基因功能的重要数据库之一,在进行GO的富集分析时,需要提供所有基因对应的GO注释信息,本文介绍几种获取该信息的方式...
what is Gene Ontology ?——基因本体论 1 , 什么是本体论?简单来说,就是我们对一个具体事物进行分类并予以描述。例如:猫是一种哺乳动物/猫是猫科动物/...
前言 pathview是一个通路可视化友好的R包,最主要的是它支持多组学数据映射(基因/蛋白-代谢)。自己用过它的R包,后来发现有网页版的,果断介绍给学员。因为不常用,记录要...
g:Profiler主要有四个可选工具: g:GOSt用于分析 flat or ranked gene lists以获得富集特征; g:Conver用于转换不同类别的基因标识...