我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程,并提供了基本的命令,用到的软件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等,在此分享出来...
APP实验室“日更挑战”,每天为你带来一款好用、好玩的工具软件 今天,APP实验室推荐给大家的是一款超级好用的在线绘图工具,Excalidraw。 Excalidraw:在线...
你好,我想问一下在测试rMATS时是不是使用的事他们自己的测试数据啊?他们数据的readLength不是50嘛?为什么你101也能跑起来呀?不会报错嘛?
RBP AS生信流程( 四)rMATsrMATs rMATs运行: 在rMATstest这个文件夹里有官网下载好的2x2测试文件: 用samtools查看bam文件: 可以看到第三列为1,代表1号染色体(这里是1...
归纳几篇eQTL相关文章。 1.转自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html 首先QTL是数量性状位点,比如身高是一个...
@hu巴 抱歉,原作者撤了文章我也不能再传播啦
【CIBERSORT】超详细,从数据下载到数据分析(初学者笔记)【CIBERSORT】超详细,从数据下载到数据分析全过程(初学者笔记) cibersort是目前引用次数最多的免疫细胞浸润估计分析工具,2015年首次发表于nature me...
求助!如果报错说"there is no package called panc8.SeuratData"该怎么办啊
SeuratData||你需要的单细胞数据分析实例数据合集SeuratData是一种使用R的内部包和数据管理系统以Seurat对象的形式分发数据集的机制。它代表了一种方便用户访问Seurat中使用的数据集的方法。 我们创建了seur...
clusterProfiler 是业界大神Y叔写的一个R包,可以用来做各种富集分析,如GO、KEGG、DO(Disease Ontology analysis)、Reacto...
难道,这不像孔雀开屏吗? 写在前面 组学数据已经泛滥,但是信息的挖掘仍任重道远。顺手的工具,可以节省使用者尽可能多的时间,或者将看起来很复杂,很难以完成的事情,变得非常简单。...
@郑宝童 谢谢呀~
[R]用R执行cibersort,根据组织的基因表达谱获取细胞的百分比CIBERSORT is an analytical tool developed by Newman et al. to provide an estimation of ...
【CIBERSORT】超详细,从数据下载到数据分析全过程(初学者笔记) cibersort是目前引用次数最多的免疫细胞浸润估计分析工具,2015年首次发表于nature me...