前面的学习笔记里,对于scATAC-seq的分析,使用的是signac R包进行的。前几天在一次偶然的机会里,有幸和一个专门做生信的老外聊了聊(纽约某校的PI),从他那里听说...
前面的学习笔记里,对于scATAC-seq的分析,使用的是signac R包进行的。前几天在一次偶然的机会里,有幸和一个专门做生信的老外聊了聊(纽约某校的PI),从他那里听说...
刘小泽写于18.9.12处理芯片数据离不开注释包,并且不同的芯片数据使用不同的注释。知道GSE号后就能知道GPL平台号,但是怎么把平台和注释信息联系起来是个问题。今天花个十几...
illumina 芯片注释文件路径:https://support.illumina.com/array/downloads.html[https://support.ill...
大家好,好久不见,这个公众号目前只有我在写,所有更新随心所欲,想起来什么就发点啥,也不为挣钱,希望能跟大家分享一些自己在生信学习中的感受。 上次我们把完整的vcf数据提取出来...
简介 可直观地查看并分析Illumina芯片平台上生成的数据。GenomeStudio2.0数据分析软件支持不同的分析: 最小系统需求 注:(1)软件分析是不需要网络的。(2...
在跟着健明老师学习生物信息学的过程中,少走了很多弯路,躲过了很多坑,在指导下浅尝过一些。但是自己常常扣原理,又双叒叕落坑,百思不得其解。以下是之前遇到的问题,今天整理带大...
(十)、分析流程及软件列表 有参转录组:针对有参考基因组序列的物种进行 mRNA 的分析。 无参转录组:针对尚无参考基因组序列发布的物种进行 mRNA 的分析。 DGE:数字...
参考生信技能树1以及生信技能树2只记录从数据下载,到最终结果展示,具体生物学知识请自行查阅稍后关于ChIP-seq的背景知识我会再发布一篇文章。数据下载:数据存放地址关于环境...
0.数据介绍 这是一篇发表在Cancer Cell 2019 Sep的文章——Single-Cell Transcriptomics in Medulloblastoma R...