@我们一起舔过铁栏杆 首先你确认下你当前使用的是gcc 4.8版本的？ gcc --version
如果不行，你试着把R的版本调低一点，3.x
Linux上基于R安装Peer包闲言一下：一般不太喜欢写这种类型的帖子的（大部分安装步骤网上重复的帖子都很多），之所以要写下这个包的安装，是因为这个包比较小众，帖子不多，再者我没想到做生信这么多年，装包无数...
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使用mysql命令从UCSC数据库获取refseq gene id to gene name
mysql --user=genome -N --host=genome-mysql.cse.ucsc.edu -A -D hg38 -e "select name,name...
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最全bcftools使用说明--只看本文就够了1 简介 BCFtools 是一款多种实用工具的集合，它可以用于处理VCF文件和二进制的BCF文件。它可以接受VCF格式、压缩的VCF格式以及BCF格式，并能自动检测输入的格...
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请教一下bcftools 怎么过滤掉太多missing samples的变异。类似于vcftools中的max-missing 操作
最全bcftools使用说明--只看本文就够了
1 简介 BCFtools 是一款多种实用工具的集合，它可以用于处理VCF文件和二进制的BCF文件。它可以接受VCF格式、压缩的VCF格式以及BCF格式，并能自动检测输入的格...
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@素瑾妍 你只要把想添加的封装好，然后ggplot2里面通过geom_text函数添加就可以。你看我例子里面就用了两侧geom_text()，分别把公式和r2加进去了。另外，这种其实效率也不好，你也可以画好图之后用AI 编辑手动添加任何文字或者注释信息都可以。
R语言散点图-- ggplot2: scatterplot()
R语言作图点滴积累，今天要记录ggplot2中散点图的做法。散点图算是数据展示中非常基础的一种方法了吧，一般用于展示两个变量之间的关系（比如线性相关）。按照惯例，我每次讲一个...
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下载源我没有特别设置，应该用的默认的。
Linux上基于R安装Peer包
闲言一下：一般不太喜欢写这种类型的帖子的（大部分安装步骤网上重复的帖子都很多），之所以要写下这个包的安装，是因为这个包比较小众，帖子不多，再者我没想到做生信这么多年，装包无数...
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PBS作业管理系统中如何批量删除用户的所有作业
如果批量提交任务后，发现有错误，想要撤回，一个一个撤回太麻烦，如何批量地杀掉指定用户所有的作业呢？只需如下一条命令就可以：qselect -u | xargs qdel
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Linux系统下文件名出现中文乱码如何重命名回来
一不小心在给文件重命名的时候输入了中文字符，结果导致文件名乱码，无法通过cat, less, rm 或者mv 之类的命令操作了。 如何重新命名它，使得其恢复正常呢？ 据说li...
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网络不好，如何通过本地安装R包
在集群服务器上使用R语言，经常会碰到很抓狂的事情，那就是服务器没连因特网，而我们要安装一些第三方的R包。以前写过一篇R包的常用安装方法(https://www.jianshu...
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如何提取一个基因组中所有intron
最近有个任务需要从基因组中提取所有的内含子（intron）区域。一开始觉得很简单，用ensembl上的biomart或者ucsc genome browser一顿猛点应该就可...
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华中科技大学同济医学院<br>在读博士
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Linux上基于R安装Peer包
闲言一下：一般不太喜欢写这种类型的帖子的（大部分安装步骤网上重复的帖子都很多），之所以要写下这个包的安装，是因为这个包比较小众，帖子不多，再者我没想到做生信这么多年，装包无数...
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R语言学习--data.table-fread函数
参考：https://cran.r-project.org/web/packages/data.table/data.table.pdf 描述 "freda" 用于常规分隔文...
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什么是可遗传性(度)?
今天读文章碰到一个生僻的概念（只是对于我这个遗传学学渣来说的），叫 ”narrow-sense heritability". 读到这个的时候，脑海里冒出来两个问号：？1. h...
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一般情况下我们都使用p<0.05作为阈值来拒绝原假设（零假设）。这个跟用哪个检验方法无关
生物学研究中常见的统计检验方法(二：Wilcoxon test)
上一篇我简单整理了t-test的用法和注意事项 （我们主要讲两个独立随机样本的t-test）。我们再回顾一下，t-test是参数统计检验方法，其应用的假设前提是检测变量的值服...
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讨厌又迷人的reads去重复在NGS分析入门阶段，我们不需要考虑太多的细节，只用知道一个分析的大致流程并完整跑下来即可。太多的细节，只会让我们对于分析产生莫须有的恐惧，因此一些“无关紧要“细节就被我们刻...
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R & Data Science & Bioinformatics<br>Website:<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Ftaoyan.netlify.app" target="_blank">https://taoyan.netlify.app</a><br>email:tyan@zju.edu.cn
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生物学研究中常见的统计检验方法(二：Wilcoxon test)
上一篇我简单整理了t-test的用法和注意事项 （我们主要讲两个独立随机样本的t-test）。我们再回顾一下，t-test是参数统计检验方法，其应用的假设前提是检测变量的值服...
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抱歉，annoText这里我忘记加在代码里了。它其实就是自己定义的一个data.frame. 有三列（对应代码中的degree,complex 和WD40id），前两列表示x和y坐标值，最后一列表示对应坐标上的label.
R语言散点图-- ggplot2: scatterplot()
R语言作图点滴积累，今天要记录ggplot2中散点图的做法。散点图算是数据展示中非常基础的一种方法了吧，一般用于展示两个变量之间的关系（比如线性相关）。按照惯例，我每次讲一个...
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好像是的，可能当时画图的时候annoText是在命令行控制台上写的，没有放进代码文件里。
R语言散点图-- ggplot2: scatterplot()
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