TCGA临床数据和各种组学数据自动批量下载和处理教程 TCGA转录组RNAseq数据下载 参数含义详细介绍 func_tcga__project__strs: 要下载的TCG...
发简信
IP属地：广东
-
TCGA临床数据和各种组学数据自动批量下载和处理教程 -
在win系统上做生信数据分析如何快速检查和填写正确的文件路径在win系统上做生信数据分析如何快速检查和填写正确的文件路径，避免分析报错 文件路径没有填写正确导致分析报错或闪退的问题 视频教程 https://www.bilibili....
-
转录组和基因表达芯片的免疫浸润分析教程和接生信分析代做服务OmicsTools软件介绍和下载 软件介绍 我开发了一款本地电脑无限使用的各领域综合全能的零代码生信数据分析作图神器电脑软件OmicsTools，欢迎大家使用OmicsTo...
-
嗯嗯，好的
获取单细胞sample_info.csv疑问
这个数据集有单细胞和RNAseq的，20,21,22是单细胞的，在根据GSE id自动下载处理GEO数据那里下载，中途报错只下载了这些文件（图3），sample_info.c...
-
只有C盘的windows系统通过磁盘分区分出D盘为什么要从C盘中分出D盘？ windows电脑的一个良好的操作规范是：C盘是系统盘，D盘是软件盘，E盘是数据盘，软件一般安装在D盘，大家的一些数据资料可以放在E盘，软件大家一...
-
甲基化组学全流程生信分析教程甲基化组学全流程分析和可视化教程 读取数据目录下的idat文件的甲基化全流程一键分析 功能简介 甲基化分析模块可以实现甲基化芯片450K, 870kEPIC数据的自动读取，可...
-
@JSlideferriswhe 我说的是你把细胞名字精简一下，条形图和热图的排版会变得更好看一些，后续我会图 umap 和 tsne 图的比例优化一下
omicsTools单细胞一些图优化的建议
单独绘制每个基因的feature plot，里面的unsplit_group_feature_plot拉太长了，一组基因的feature plot拼图绘制那里的话就是压的太扁...
-
@JSlideferriswhe 你构建分组信息的时候，没有用到所有的样本，出现了这个问题
读取单个单细胞表达矩阵文件count.txt.gz的问题求助3
质控这里根据大佬提示加了sample,运行会报错，图3是1.seurat下的metadata文件，图5是sample_info_sub.csv文件
-
有很多图看起来不好看，主要就是你的细胞名字太长了，你把细胞的名字精简一下，有些有的图我会再优化一下
omicsTools单细胞一些图优化的建议
单独绘制每个基因的feature plot，里面的unsplit_group_feature_plot拉太长了，一组基因的feature plot拼图绘制那里的话就是压的太扁...
-
@JSlideferriswhe 你的这个问题是你的原始样本注释信息里有22个样本，单细胞的meta.data文件中也应该是22个样本，但是你后面构建的分组信息里样本编号数量没有22个，导致无法跟单细胞的meda.data中的样本编号完全匹配，给单细胞的meta.data的所有样本都注释出分组信息，就出现了错误。
读取单个单细胞表达矩阵文件count.txt.gz的问题求助2
首先根据文章作者提供的metadata文件（图一），以及作者的count.txt.gz，随后读取成功得到metadata.csv和single cell_raw_scRNAs...
-
@JSlideferriswhe 发这一步的 rds 文件和 meta.data 文件
所有类型细胞中基因在不同分组的差异表达分析疑问
做这一步的时候用7.cell_anno里面的7.cell_anno_scRNAseq_seurat_cluster_res.rds能跑成功，但是用7.cell_anno_me...
-
@JSlideferriswhe 如果你有数据集运行成功，这个数据集遇到问题，可能是你这个数据集有些问题，这样，你发我30块红包，把你的这个数据集发给我，我帮你看看你的这个数据集
所有类型细胞中基因在不同分组的差异表达分析疑问
做这一步的时候用7.cell_anno里面的7.cell_anno_scRNAseq_seurat_cluster_res.rds能跑成功，但是用7.cell_anno_me...
-
你还要看看你填的这些列名参数是不是都在你的meta.data文件中存在，且是对的
所有类型细胞中基因在不同分组的差异表达分析疑问
做这一步的时候用7.cell_anno里面的7.cell_anno_scRNAseq_seurat_cluster_res.rds能跑成功，但是用7.cell_anno_me...
个人介绍
OmicsTools 零代码生信分析神器电脑软件作者，全网账号邢博士谈科教，分享生信技能知识，提供生信个性化分析，科研作图和论文复现等服务。 TB店铺: 生信研究 如果大家觉得我的内容对您有用，欢迎关注一下我的账号，谢谢