结果文件的解读 输出文件1:*.variant_function 第一个文件包含所有变异的注释,方法是在每个输入行的开头添加两列(例如,第一行下面的“intergenic ...
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之前的文章里已经按照教程进行了TCGA数据库的一些练习(RNA-seq、芯片、生存分析),现在学习TCGA甲基化数据的分析过程。 参考文章:1.甲基化的一些基础知识2.Mak...
参考染色体大小文件chrom.size 将染色体划分为20bp为一个bin的区间 将染色体划分成20bp为一个bin滑动距离为10bp的区间 将每条染色体划分为5个相同大小的...
在用MEME-chip进行模体搜索时,需要将fasta格式的文件上传,而上传的数据又必须是大于50bp且等长的序列,这个时候就要对数据进行序列截取。此处将介绍两种截取序列的方...
PSI值:(再翻墙找一下答案) PSI ( Percent-spliced-in,拼接百分比)可以针对isoform, exon, ASE 进行计算,对于ASE来说, PSI...
今天和大家分享的是2020年3月发表在Frontiers in Genetics(IF:3.517)上的一篇文章,“Modulator-Dependent RBPs Chan...
找到感兴趣的基因组 打开UCSC,把鼠标置于导航条的 “Genomes”; 从左边的进化树中找到感兴趣的并点击,或者从genome下拉菜单中选中便捷链接hg19,hg38,m...
生物信息学数据库可以分为4大类:即基因组数据库、核酸和蛋白质一级结构数据库、生物大分子三维空间结构数据库,当前研究比较热点的集中于基因组、miRNA、LncRNA、circR...