Seurat官网：https://satijalab.org/seurat/articles/conversion_vignette.html[https://satijal...
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Seurat对象、SingleCellExperiment对象和scanpy对象的转化 -
Seurat包之导入单细胞数据方式汇总挖掘公共单细胞数据集时，会遇到常见各种单细胞测序数据格式。现总结如下，方便自己日后调用，以创建Seurat对象（1）barcodes.tsv.gz、features.tsv....
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Provided graph.name not present in Seurat object
报错如下 1. 如果你是运行如下代码报的错。 则添加一行代码即可，如下 2. 如果不是，看下面 2.1问 Sorry for disturbance.My question ...
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R将列表（list）转换成数据框/矩阵
淡水鱼写于2020/2/15 将列表转换成矩阵，接着由矩阵转换成数据框。Eg.a,b,c,d,e均是R中的变量。 1-要掌握matrix()函数的用法，如果list_eg中每...
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单细胞转录组学习笔记-5-熟悉文献作者提供的两个表达矩阵刘小泽写于19.6.17-第二单元第三讲：熟悉文献作者提供的两个表达矩阵 笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术课程链接在：ht...
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SingleR单细胞类型自动注释与celldex参考数据包SingleR包可基于参考数据集，实现对单细胞数据细胞类型的自动注释。celldex包提供若干常用的人/老鼠的注释细胞类型的Bulk RNA-seq/microarray参考...
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R语言中的switch函数用法
R语言中的switch与其它语言中的switch有很大区别。 在R中，switch函数的语法形式如下： 其中，expr为表达式，其值或为一个整数值或为一个字符串；list为一...
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linux cut 命令提取指定列1、创建了一个示例数据a.txt seq 11 30|xargs -n 5|sed 's/ /\t/g' > a.txt 提取第一列 ： cut -f 1 a.txt 提取第...
