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  • 三代结构变异检测

    我在分析三代结构变异检测的时候遇到一些问题 ,在运行Iris时的报错记录一下,这个是github上面一个报错截图,和我 整体的流程是ngmlr 比对,sniffles鉴定结构...

  • 这得是踩过多少坑才能写出来,又得是多么蛋疼,才能查到这一条经验啊!

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    单细胞数据处理小细节汇总

    1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后,矩阵默认会变成SCT矩阵,如果不加设置,后续的PCA等操作都是基于SCT矩阵。修改Defau...

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    seurat-ScaleData()源码解析

    一、ScaleData()简介 单细胞基因表达counts矩阵数据经过NormalizeData()归一化处理后,还需要进行scale标准化。ScaleData()[http...

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    单细胞PCA分析的降维原理

    一、PCA简介 1. 相关背景 在许多领域的研究与应用中,往往需要对反映事物的多个变量进行大量的观测,收集大量数据以便进行分析寻找规律。多变量大样本无疑会为研究和应用提供了丰...

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    聊聊“基因组共线性”

    最近看了几篇关于共线性分析的微信/简书推送,发现不少研究人员把“编码基因共线性”错误地描述为“全基因组共线性”。这是两个完全不同的概念,前者主要是基于蛋白水平,蛋白的保守性很...

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    Hi-C技术的初步了解

    最近的一次组会上看到实验室的同学汇报的结果里有Hi-C的图,所以我就悄咪咪的去了解了一下Hi-C技术的原理。整理一下。 Q1: Hi-C的全称是什么? A: 高通量染色体构象...