目标：这个研究的目的是通过单细胞测序探究TAC小鼠心脏巨噬细胞的异质性，寻找与心脏损伤有关的巨噬细胞亚群。方法和结果：作者从CD45+的单细胞测序数据中选择了所有的巨噬细胞，...
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文献学习012--[sc]心脏免疫细胞单细胞转录组分析揭示Rel驱动CD72阳性巨噬细胞诱导心肌损伤 -
再见了Excel，我有Python了！
前言 越来越多开发者表示，自从用了Python/Pandas，Excel都没有打开过了，用Python来处理与可视化表格就是四个字——非常快速！ 下面我来举几个明显的例子 1...
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复现详解：纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度一 .从GEO数据库中下载表达矩阵文件 GSE112996_merged_fpkm_table.txtGSE112996_series_matrix.txt，把GSE1129...
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TCGA数据差异分析后生存分析（批量单因素cox回归/Lasso筛选，多因素cox建模，时间依赖ROC曲线及KM plot可视化）测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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Seurat4.0系列教程18：Weighted Nearest Neighbor Analysis（WNN)）同时测量多种模式的数据，也称为多模式分析，代表了单细胞基因组学的一个令人兴奋的前沿，迫切需要新的算法来定义基于多种数据类型的细胞状态。每种模式的不同信息内容，即使是在同一数据...
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相关性分析 | R语言 -- 相关性矩阵及可视化感谢各位简友一直的关注。 请关注：感谢陪伴[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg4MjY2NTA2Nw==&mid=2247483891&...
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