生存分析 K-M分析 定义：KM分析即乘积极限法（product-limit method），是现在生存分析最常用的方法。是由Kaplan和Meier于1958年提出，因此称...
IP属地：湖南
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公众号-科研私家菜学习记录（6）
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公众号-科研私家菜学习记录（5）
交叉验证与模型选择 定义：亦称循环估计，是一种统计学上将数据样本切割成较小子集的实用方法。可以先在一个子集上做建模分析，而其它子集则用来做后续对此分析的效果评价及验证。一开始...
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公众号-科研私家菜学习记录（4）
岭回归 定义：岭回归，又称脊回归、吉洪诺夫正则化（Tikhonov regularization），是对不适定问题（ill-posed problem)进行回归分析时最经常使...
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公众号-科研私家菜学习记录（3）
无序多分类Logistic回归 定义：研究的因变量类型为多分类无序资料，应采用多分类无序Logistic回归模型分析。（有序多分类Logistic回归模型在调整连接函数后仍不...
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公众号-科研私家菜学习记录（2）
泊松回归 定义：当因变量是单位时间某事件的发生次数时就应该考虑用泊松回归，比如想研究的因变量是过去一个月病人发生脑卒中的次数，就考虑用泊松回归。 分析代码： OR值计算
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公众号-科研私家菜学习记录（1）
广义线性模型 线性模型的扩展，通过联结函数建立响应变量的数学期望值与线性组合的预测变量之间的关系。其特点是不强行改变数据的自然度量，数据可以具有非线性和非恒定方差结构。是线性...
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R语言学习笔记精选
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Linux及相关生信技能笔记
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视频在https://www.bilibili.com/video/av49363776 ，如果大家R语言能力不够，就主要学习网页工具 https://www.cbioportal.org/ 等等，如果R语言还行，就看代码: https://github.com/jmzeng1314/tcga_example 如果确实有需要，还可以看看我们的付费内容：地址是 http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/index.html
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收集一些生物信息学的分析流程的文章。感谢这些简友整理的生信分析流程！ 如果简友投稿没有被我收入专题，可能是我没看到或者收入到其他针对性更强的专题中了。望见谅！ 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 👣 全基因组测序(WGS)分析 👣 转录组分析RNA-seq的分析流程 👣 染色质免疫共沉淀技术ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 👣 单细胞scRNA-seq分析 👣 癌症的预后标志物查找 👣 系统发育演化进化树构建与分析 👣 群体遗传学分析 👣 全基因组关联分析(GWAS) 👣 基因家族的分析 👣 甲基化测序与分析 👣 KEGG/GO功能富集分析 👣 图形绘制具体细节的比如热图、曼哈顿图的绘制等 👣 python、perl、R的包的使用过程 👣 具体工具的使用，比如GATK的使用过程 👣 数据库的挖掘方法，比如TCGA数据库的使用 👣 另外就是整个文章走下来的流程 👣 👣 👣
