luly

LD衰减距离指的是，当平均LD系数衰减到一定大小(最大值的一半/0.5以下）的时候，对应的物理距离。通常用LD衰减距离来描述LD衰减速度。LD衰减速度越快，即衰减距离越小，说...

花生学生信

LD（Linkage Disequilibrium）连锁不平衡是指在一对基因座或基因组区域中，两个或多个等位基因的组合频率与它们在随机组合假设下的期望频率之间存在显著差异。简...

随缘鸿珠

一、什么是单倍型？ 在单倍型分析前，首先需要明白什么是单倍型、什么是基因单倍型？ 一般来讲，所谓的单倍型是指同一染色体上不同变异位点的各种线性组合形式。那么基因单倍型自然就是...

BeeBee生信

按：RNA-seq 流程非常多样化，每一个步骤可选工具都非常多。我的选择是 StringTie 进行组装取得 read counts 数值，DESeq2 分析差异基因。这里把...

爱学生信的小菜鸡

前言 我在犹豫是否补充一篇怎样拆分染色体进行比对和变异检测（主要是为了提高比对和变异检测效率）的帖子。开始没有规划这篇内容的原因有两点：一是内容比较简单，觉得可能用处不大；二...

xuzhougeng

接着上一篇留下的问题，如何按照以1M为窗口，每次移动10Kb计算均值。我们以KY131是"0/0", 而 "DN422" 是 "1/1"的位点结果为例，我们来增加这条线 原...

陈牛牛

在使用杂交群体定位QTL的过程中，交换单株的选择是至关重要的。 首先需要明白什么是交换单株。父本植物（基因型为AA）与母本植物（基因型为BB）杂交，得到的F1代含有来自A与B...

纪伟讲测序

Venn图经常用于表现组间重叠元素的数量信息。但是随着分组数量的增多，Venn图的结构会越渐复杂，如下所示，当分组数量为5组时，已经不容易从中识别交集概况了。因此，这也是为什...