在查找了相当一部分资料发现，NEGAHIT对于微生物的无参组装比较适合，在SOAP denovo官网网页都有说明。 安装 使用conda直接安装 然后检查是否安装成功： 使用...
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MEGAHIT 微生物 de novo 组装
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WGS变异分析后，下游进行maftools分析经过WGS上游分析之后，会产生类似于样本对应的*_hg38_multianno.txt文件： 然后通过合并txt文件，调整数据，生成一个多样本融合txt文件： 一、通过脚本合...
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kmergenie 安装及使用由于需要做微生物的De novo无参组装，查了一些资料发现大多软件需要先确定K值，而kmergenie能够根据数据的得到最佳的K值，下边记录一下安装过程 依赖： python...
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服务器端部署网站上线
Step1: 首先把所有写好的文件放在html这个文件夹中，然后上传文件到服务器 Step2: 在服务器创建/var/www/html文件夹，并把上一步的文件转移到这个文件夹...
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Bulk RNA-seq上游分析流程（Salmon）
转录组分析一般通过比对或非比对的方法对基因表达进行定量，得到一个样本-基因表达矩阵用于下游数据分析。下游分析通常是进行差异表达分析，对差异基因进行功能注视，如Gene Ont...