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发简信
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    黄甫一
    单细胞转录组基因表达模式聚类-Mfuzz包 2022-12-06

    适用条件和背景 Mfuzz包最初是为了研究具有时间序列特征的转录组和蛋白组数据中基因或蛋白表达的时间趋势的一个工具包,能将具有相似表达模式的基因或蛋白进行软聚类,从而可以了解...

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    纪伟讲测序
    使用clusterProfiler进行GO、KEGG富集分析(有参情况)

    寻找差异表达的基因并识别它们的功能,是我们进行RNA测序的最主要目的。很明显,这些差异的基因必然与功能改变密切相关,例如,比较患病个体与正常个体的组织表达谱,不难想到这些显著...

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    木舟笔记
    R实战 | Lasso回归模型建立及变量筛选

    R实战 | Lasso回归模型建立及变量筛选 Tibshirani(1996) 引入了 LASSO (Least Absolute Shrinkage and Selecti...

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    kkkkkkang
    转录组DEGs聚类热图和功能富集分析

    写在前面:经常做转录组分析,就是把差异基因搞个火山图和Venn图看各组差异基因的共有和特有情况。看见有个比较好的选择,能直观比较各种处理带来的影响,如下: 来自Nature ...

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    小明的数据分析笔记本
    跟着Cell学作图:R语言ggplot2作图展示差异表达的基因

    一组对照加处理这种实验的差异表达分析结果通常是用火山图来展示,如果是很多组实验的话如何展示,这种情况我之前还没有遇到过。公众号后台有读者留言问到了如下的图 这个图来自于论文A...

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