使用Snakemake搭建分析流程 目前已有的框架 A review of bioinformatics pipeline framework 的作者对已有的工具进行很好的分...
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[转]snakemake--我最喜欢的流程管理工具 -
Snakemake 集群提交和样本获取
samples获取 在samples.json文件中写入样本信息。 读入json文件。FILES = json.load(open("test.json")) FILES是一...
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Conda 以及 Snakemake 安装及使用防止自己下次忘了，作为笔记使用，整理自网络。参考自Snakemake：简单好用的生信流程搭建工具 | | 百迈客生物 (biomarker.com.cn)[http://ww...
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第九章 通过Snakemake实现流程自动化 Pipeline Automation via Snakemake
介绍 凭借经济高效的全基因组测序和广泛公开的数据，新一代生物信息学方法进入了超高通量领域。例如，最近发表的覆盖度超过30x的 10 多个小麦基因组的组装或用泛基因组取代单一参...
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机器学习实战 | Python机器学习算法应用实践引言 本篇文章希望带大家完整走一遍机器学习应用流程，我们会讲解到基于Python的机器学习算法，应用在结构化数据和非结构化数据(图像)上，希望通过文章内容帮助大家在案例中重温...
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聊聊“基因组共线性”最近看了几篇关于共线性分析的微信/简书推送，发现不少研究人员把“编码基因共线性”错误地描述为“全基因组共线性”。这是两个完全不同的概念，前者主要是基于蛋白水平，蛋白的保守性很...
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RNA_seq（1）植物转录组差异基因分析简单练习
RNA_seq植物实战 Author : yujia 目录：概述salmon工具完成索引建立和生物学定量subread工具完成序列比对和定量DESeq2差异基因分析总结 一、...
