这里是佳奥! 2022年的最后一天,让我们继续ATAC-Seq的学习! 1 计算插入片段长度 非冗余非线粒体能够比对的fragment、比对率、NRF、PBC1、PBC2、p...

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ATAC-seq信息分析流程主要分为以下几个部分:数据质控、序列比对、峰检测、motif分析、峰注释、富集分析,下面将对各部分内容进行展开讲解。 一、测序数据过滤与质量评估 ...
可以使用conda 安装sickle 但是无法使用,也有人有一样的问题sickle not found though installed. · Issue #58 · naj...
htseq-count运行之前需要判断链特异性查阅得知方法为RseQC软件安装后报错 参考Github解决方案[https://github.com/pysam-develo...
测序深度 测序碱基总量 单端测序=reads长度 * reads个数 双端测序=单端reads长度 * 单端reads个数 * 2 通常测序数据量的单位都是用“G"表示,例如...
插入片段 参考网站什么是“插入片段”? [https://zhuanlan.zhihu.com/p/41782202]插入片段[http://www.bio-info-tra...
待续
待续
vcf格式文件处理大全[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI2MjA1MDQxMg==&mid=2649709537&idx=1&sn=1...
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BED 文件格式 [https://www.jianshu.com/p/b4843c39d677]Genome Browser FAQ [https://genome.ucs...
mRNA生信分析常规流程 [https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUwOTg0MjczNw==&mid=2247489620&idx=1&sn...
第一、第二、第三代测序原理[https://www.bilibili.com/video/BV1oa4y1H7CU/?t=31&vd_source=4525116f3ef07...
GTF文件格式[https://blog.csdn.net/weixin_43569478/article/details/108079233] GFF,GTF[https:...
to be continued
简介 SAM存储格式:不同平台下机数据,经过不同比对软件后有一个统一的存储格式。SAM(Sequence Alignment/Map format简写)格式文件,存储测序数据...