一、deepmod 1、三代测序得到的fast5文件是muti fast5，一个fast5文件里面有4000条fast5序列，deepmod不支持muti fast5，需要拆...
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三代ONT甲基化相关分析软件
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热图去掉聚类树但是保留聚类
看到这个问题，你可能搜了好多答案，比如 热图如何去掉聚类树的同时保留聚类的顺序？ - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/e...
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我的生信自学心得分享
这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年，我开始自学生物信息，那个时候，为了加深自己学习，所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客，xu...
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转座子（TE,散在重复）特征及其对基因组影响基因组中重复序列大体分为两类：串联重复（Tandem repeats，Tandem Duplication） （TRF可预测）散在重复（Dispersed repeats），...
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gemoma安装与简单用法
gemoma是根据已知参考基因组的注释，给未知基因组注释的软件，貌似网上仅仅有提到，却没有具体的用法，笔者研究了一下，写下以下傻瓜式攻略，给大家参考安装很简单，直接用cond...
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差异表达基因分析：差异倍数(fold change), 差异的显著性(P-value)Differential gene expression analysis：差异表达基因分析 Differentially expressed gene (DEG)：差异表达...
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RNA-seq(6): reads计数，合并矩阵并进行注释任务 1.实现这个功能的软件也很多，还是烦请大家先自己搜索几个教程，入门请统一用htseq-count，对每个样本都会输出一个表达量文件。2.需要用脚本合并所有的样本为表达矩...
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RNAseq006 转录组入门(6)：reads计数传送门： RNAseq005 转录组入门(5)：序列比对RNAseq004 转录组入门(4)：参考基因组下载RNAseq003 转录组入门(3)：了解fastq测序数据RNA...
