R包文档参考：https://www.metaboanalyst.ca/docs/RTutorial.xhtml#Workflow:%20Case%20Study%201[h...
IP属地：湖北
-
MetaboAnalystR包灵活、可重复的分析代谢组数据 -
R包MetaboAnalystR安装指南（Linux环境非root）前言 这是代谢组学数据分析的一个R包，包括用于代谢组学数据分析、可视化和功能注释等众多功能。最近有同事在集群中搭建蛋白和代谢流程，安装这个包出现了问题，于是我折腾了一上午。 ...
-
批量压缩文件
macos 打开终端pwd 查看当前目录cd 路径 设置要压缩的文件夹所在的位置采用for 循环如我的example文件下有大量fastq文件，可设置 注意子目录后缀进行更改
-
RStudio - 保存环境
https://www.jianshu.com/p/9ada0b34e376?ivk_sa=1024320u[https://www.jianshu.com/p/9ada0b...
-
关于ANCOMBC
https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ANCOMBC/inst/doc/ANCOM.html[ht...
-
关于MaAsLin2
1.Adjust alpha diversity using covariates as fixed effect in Maaslin2## https://forum.b...
-
更多教程请关注“生信学习者”
-
大型文件的查看（tsv）
macbook可以采用“终端” 命令行工具: 在命令行中使用类似于less（在Linux和macOS上）或more命令来查看文件内容。这些工具不会将整个文件加载到内存中，因此...
-
临床预测模型 第4章PSM: 平衡和矫正混杂因素 慎重选择：可能会造成选择性偏倚。因为匹配后，贫血组和非贫血组都删掉部分人。那些删掉的人可能就是有心血管事件的人。比较靠谱的方法是：想在原始数据上...
-
数据分析：微生物数据分析方法讲解拆解地址 14 种差异分析方法步骤以及原理初解[https://xbiomeanalysis.github.io/XMAS_tutorial/principals-of-di...
-
用R完成倾向性得分匹配倾向性得分匹配是一类基于反事实理论的数据预处理方法，在医学和政策研究中被广泛应用。R中有几个很优秀的包可用于开展倾向性得分匹配，而其中功能较强、知名较广、使用方便的当属Mat...
-
倾向性评分匹配完整实例（R实现）倾向性评分匹配（propensity score matching, PSM）主要是在随机对照试验(Randomized controlled trials,RCT)中用于衡...
-
psModel <- glm(formula = swang1 ~ age + sex + race + edu + income + ninsclas +
cat1 + das2d3pc + dnr1 + ca + surv2md1 + aps1 + scoma1 +
wtkilo1 + temp1 + meanbp1 + resp1 + hrt1 + pafi1 +
paco21 + ph1 + wblc1 + hema1 + sod1 + pot1 + crea1 +
bili1 + alb1 + resp + card + neuro + gastr + renal +
meta + hema + seps + trauma + ortho + cardiohx + chfhx +
dementhx + psychhx + chrpulhx + renalhx + liverhx + gibledhx +
malighx + immunhx + transhx + amihx,
family = binomial(link = "logit"),
data = rhc)
运行这段时，总是提示y应该介于0到1之间。这是怎么回事？ -
基于LEfSe分析进行微生物物种差异及关联分析LEfSe（LDA Effect Size）分析是一种用于发现和解释高维度数据生物标识（基因、通路和分类单元等）的分析工具。在微生物分析过程中，这种分析方法主要采用线...
-
Less is more. <br>公众号：折耳根说
-
用R实现倾向性评分匹配
几日前，一肿瘤医生回顾性收集了本院2008-2018年某主任主治的某癌所有病例资料，欲验证A方法和B方法对该种肿瘤病人生存时间的差异。尝试匹配无果，遂来咨询。今天就和大家一同...
-
PCA(principal component analysis,主成分分析)1. 简介 PCA(Principal Components Analysis)即主成分分析，也称主分量分析或主成分回归分析法，是一种无监督的数据降维方法。首先利用线性变换，...
-
【代谢组学】3.数据分析非靶向代谢组实验设计 1.代谢物提取，一般要求每组至少10个样；2.在所有提取好的样本中取等量混合作为QC；3.QC样本与实验样本穿插上机，开始十个QC，结尾三个QC，中间每...
-
CPDA注册数据分析师、微软Excel认证专家
