发简信
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Conpair---配对样本检查一致性及样本污染情况
https://github.com/nygenome/conpair 依赖：python、numpy、scipy、GATK3 numpy、scipy安装： GATK4无法使...
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python学习(1)——join(),set(list)
1.今天做文件切割再写入另一个文件，将字符串和列表同时写入时报错，查了join()函数,然后再用的时候发现list第一列被"吃掉了"。研究半天才发现，是被自己蠢哭，字符串末尾...
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GATK4-部分工具包常用参数记录
VariantFiltrationFilter variant calls based on INFO and/or FORMAT annotaitions. 不能使用VQS...
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Annovar(1) 注释也能输出vcf格式（--vcfinput）
一直知道用table_annovar.pl的输入文件可以是vcf format也可以是avinput format，今天才发现输出文件也可以是vcf format： 1）不仅...
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GATK4-Mutect2-FilterMutectCalls
最近在搭建大panel（528基因）Tumor-Normal样本分析的管线，用的是GATK4-Mutect2工具。 1.GATK4用到的数据库（b37） 2.Mutect2 ...
