背景 上次选择了一个新开发的跨平台归一化工具 MatchMixeR,(失败了),但是在文章里发现作者把自己的工具与已有的工具进行比较,顺藤摸瓜发现已经有了很多类似的工具。 “...
背景 上次选择了一个新开发的跨平台归一化工具 MatchMixeR,(失败了),但是在文章里发现作者把自己的工具与已有的工具进行比较,顺藤摸瓜发现已经有了很多类似的工具。 “...
样本提取是实验关键一环,没有好的样本,一切数据就犹如没有地基的大厦,盖得越高,倾覆的概率就会越大!所以开展好一个实验,首先要从评价核酸质量是否达标开始,RIN值是样本检测中比...
安装配置conda 使用清华源下载sh脚本并安装 下载完成后直接运行脚本文件bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh。需要输入yes然后等...
筛检实验和诊断实验的区别 筛检(screening) 通过快速的检验、检查或其他措施,将可能有病但表面上健康的人,同那些可能无病的人区别开来。 筛检不是诊断实验,仅是一种初步...
刘小泽写于2020.5.18上次看了热图如何去掉聚类树的同时保留聚类的顺序 ,有朋友留言给出了其他的解决方法,非常感谢!文中会给出答案另外,这次还是带着数据,去看看pheat...
Copy number variation analysis - facets facets 是存储在 GitHub 上的R包。 factes 的开发基于 ASCN(all...
如果你做了全基因组、全外显子组或者targeted sequencing,拿到了一堆基因变异位点(SNP),下一步你该分析点什么? 如果还没有头绪,你可以认识一下这个神器:m...
实用Seurat自带的热图函数DoHeatmap绘制的热图,感觉有点不上档次,于是我尝试使用ComplexHeatmap这个R包来对结果进行展示。 个人觉得好的热图有三个要素...
刘小泽写于2020.2.8大概回顾一下基础知识 一:ORF与CDS ORF:open reading frame(开放阅读框) 它是理论上的蛋白编码区,一般是先在DNA序列中...