因为手中有几千条关键信息需要整理,所有的信息都规整的用txt保存,但是我只需要其中有关键字后面的value值,怎么搞呢?几千条信息手动肯定是不可能的,然后刚刚学习python...
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本文使用某宏基因组测序数据中的种水平类群丰度表,并直接根据所有种相对丰度总和,提取出top10丰度的种类群,作图展示这些种的丰度组成,top10外的类群合并为“Others”...
由于没有服务器,只能自己捣鼓着用windows的cmd命令行来批量下载一些数据,但是windows下高通量测序数据(如sra)下载体验真的很差,没办法,只能硬着头皮去搞 一、...
前几天,实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的选择压力分析,没想到却在多序列比对这一环节出现了棘手的问题。...
测序数据预处理——质控:Trimmomatic 测序数据预处理——质控统计:FastQC 序列组装与基因预测——拼接:MEGAHIT 序列组装与基因预测——ORF预测:Pro...
1.PICRUSt简介 PICRUSt全称为Phylogenetic Investigationof Communities by Reconstruction of Uno...
之前在自己的电脑上折腾过一段时间生物信息学,被各种软件的安装、数据的下载折腾到吐血。虽然现在网上的教程很多,但总还是会卡在一些地方无法顺利进行下去。更不要说一旦换了电脑所有的...
这次分享一下简单的生信数据挖掘发文思路,文章发表在Biomed Research International上,该期刊的影响因子:2.276,中科院分区:4区,参考范文出处:...
以下教程中vsearch和usearch部分的操作在虚拟机中的ubuntu18系统下进行。 1. 示例数据的下载 2. 双端reads的合并 3. 引物剔除和数据质控 4. ...