240 发简信
IP属地:云南
  • 120
    生信步骤|kmc+genomescope进行基因组调查

    在组装未知基因组时,往往需要利用重测序数据提前进行基因组调查,以获取其基因组规模,杂合率,重复序列比例,GC含量等信息。从而更好地拟定后继测序策略。基因组调查可以采用kmer...

  • GWAS分析-说人话(22)-"最终章"

    前言 “天下没有不散的筵席”~ 正如开章所说“这个年代,谁™还有人做GWAS啊?!” 也没有想到这个系列是最受欢迎的, 亲们所看到1-21章操作出来的文章,今天的状态更新了 ...

  • 120
    原始数据上传NCBI-转录组数据

    经常碰到老师在文章接收过程中,编辑要求将原始数据上传NCBI,要是没有数据上传经验的不要慌,小编手把手教你如何快速上传数据至NCBI (一)NCBI账号:上传数据必须有自己的...

  • 用python合并RepeatMasker预测结果中染色体的overlap区域

    前言 RepeatMasker是一个通过已有数据库预测重复序列的软件,可以筛选DNA序列中的散在重复序列和低复杂序列,是重复序列注释的重要软件。 问题 我们想对RepeatM...

  • 120
    用python做生物信息数据分析(2-pysam)

    写perl的思维,可能确实不能拿来学python。毕竟,python的裤子有很多。面向对象的语言,如果不好好穿裤子,怎么找对象?。手上要做的事情,需要解析sam,更或者bam...

  • 120
    植物启动子-顺式作用元件-批量提取-预测-可视化分析

    写在前面 以前总看到问题是,基因结构可视化的问题;现在则变成了启动子元件的预测或者说可视化。这本身比较简单,也比较玄乎,所以我一直不是太乐意与别人讨论。但学院今天断网,手上的...