0.仅作笔记使用 我所用到的所有脚本可以+Q 840842906索 简单介绍一下方向也可以，说不定以后能互相帮忙～ 1. 这个工具有在线网页版，当然KEGG注释还有其他很多工...
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宏基因组 - (3)使用KofamKOALA对非冗余基因集进行KEGG注释 -
@1c43f522e1c3 biopython没用过，知道bio系列的很多操作都封装好了
python重命名fasta序列
fasta文件的序列名很乱怎么办，自然是python重命名它喽。 这里只展示两种命名方式，一种是在“>”后面插入想要的字符串，后面的内容不变;另一种是按照升序的方式，结合给的...
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一个表白程序的编译与打包七夕就要到了，特意在github上搜了搜表白程序，发现了个CPP(C艹)写的程序，基于Qt widget (cpp)的一个表白动画程序。链接为https://hub.fast...
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阿里云盘大文件及压缩文件分享---以7645.45 MB的SGB.Jan19为例
以PhyloPhlAn 3.0使用的7645.45 MB的SGB.Jan19数据库上传到阿里云盘并分享为例。 众所周知，目前阿里云盘上传和下载都不限速，空间也比较大，很适合储...
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通路是的，map和ko一样，不过7. Drug Development这个有map没有ko，笔记还有要改的地方
kegg pathway解析并对应map号和ko号
昨天kegg pathway解析[https://www.jianshu.com/p/beb0c3727a15]不是说后面补上map号和ko号的对应关系吗，今天补上。 昨天的...
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使用Julia给出两点经纬度直接计算距离给出两点之间的经纬度，计算两点之间的距离，使用如下公式：三角函数不必说了，Lat12是两点的纬度差，Lon是两点的经度差，Lat1和Lat2分别是两点的纬度，6378.137...
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kegg pathway解析并对应map号和ko号
昨天kegg pathway解析[https://www.jianshu.com/p/beb0c3727a15]不是说后面补上map号和ko号的对应关系吗，今天补上。 昨天的...
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kegg pathway解析kegg pathway解析之前写过，链接在此:kegg pathway三级层级结构转对应表格[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU3MzE...
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prokka注释tsv文件统计
Prokka: rapid prokaryotic genome annotation .tsvTab-separated file of all features: loc...
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awk也很棒，能给出例子吗，awk知道一点
python重命名fasta序列
fasta文件的序列名很乱怎么办，自然是python重命名它喽。 这里只展示两种命名方式，一种是在“>”后面插入想要的字符串，后面的内容不变;另一种是按照升序的方式，结合给的...
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Rserver源码安装我又从源码安装Rstudio-server了，前面安装的几次都是在手机上安装的，均以失败告终，这次不一样，在电脑上安装的，成功了，特此记录成就。 为啥要从源码安装呢？原因有三...
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python重命名fasta序列
fasta文件的序列名很乱怎么办，自然是python重命名它喽。 这里只展示两种命名方式，一种是在“>”后面插入想要的字符串，后面的内容不变;另一种是按照升序的方式，结合给的...
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KO丰度转换为pathway丰度经常会遇到已经有KO-number(代表基因家族信息)在各样品中的丰度，如何转换为level3等级的KEGG pathway(通路)丰度表呢？ 目标如下： 转换为 首先你要通...
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WSL Ubuntu 18.04安装R 4.0及tidyverse并解决xml2的安装问题
首先说说为什么要写这篇文章，原因有二：其一，WSL Ubuntu 18.04默认的R为3.4版本有点旧，想用最新版4.0+的；其二，之前切换过ubuntu 18.04的R版本...
