Seurat_Satija

CIBERSORT的注意事项 CIBERSORT的使用，我们举了几个例子，但是还有一些疑问，只要有疑问在，就感觉心里不踏实。比如：1.CIBERSORT需要什么样的数据？是芯...

可能性之兽

对于sam文件格式，已经有很多人写过相应的中文介绍文章，但是基本上都是简单粗暴的讲了一下每个字符代表什么，但是如果真去研究的话有时候还是感觉有点这些写的还是让人懵逼，比如不知...

Hayley笔记

NMF算法简介 非负矩阵分解(Non-negative Matrix Factorization, NMF)的思想可以描述为，对于任意给定的一个非负矩阵V，NMF算法能够找到...

土豆干锅

一、scMetabolism的安装 scMetabolism是一个R包，用于在单细胞分辨率下量化代谢活性，目前只适用于物种是人的单细胞数据。作者推荐使用seurat的数据进行...

六六_ryx

上一步骤（第6篇：重复样本的处理——IDR）用IDR对重复样本peaks的一致性进行了评估，同时得到了merge后的一致性的peaks——sample-idr，接下来就是对p...

切瓜少年

1 关键细胞类型或Marker缩写： 骨髓多能造血干细胞 HSC 淋巴样祖细胞 lymphoid progenitor cell T细胞抗原识别受体 TCR 抗原提呈细胞 A...