当下的农业生产中，每年都会遭受来自生物或非生物胁迫带来的损失。想要挽回损失，进行作物抗性育种，就迫切需要理解植物对于外界胁迫的响应。植物细胞内NLR蛋白是一类识别病原微生物效...
发简信
IP属地：湖北
-
每周文献|NLR蛋白揭示免疫通路与干旱通路共进化 -
全基因组水平上NLR pair鉴定
1 NLR pair定义 NLR pair(NLR 功能对)，是在染色体上有着明显“头对头”排列特征，两个基因协同调控免疫反应，其中起识别效应蛋白作用的基因称为Sensor，...
-
关于多基因组CRE-orthologues鉴定
对于多基因组CRE鉴定，文献给予了方法， To identify orthologues of the 52,169 sugar glider candidate cis-r...
-
Dfoil - 推断祖先基因流-2. 在一篇讲泥炭藓的MBE看到了dfoil的使用 《Extensive Genome-Wide Phylogenetic Discordance Is Due to In...
-
「基因组」基因组补gap软件
最近看到的一些T2T补gap软件软件： softwareDownloadTimeArticleJournalquarTeThttps://github.com/aaranyu...
-
统计基因长度的方法
fasta格式是一种基于文本用于表示核酸序列或多肽[https://baike.baidu.com/item/%E5%A4%9A%E8%82%BD/1511295?fromM...
-
记录odgi 用法
odgi 把GFA文件按染色体拆分 odgi 提取PGGB泛基因组子图 gfabase 提取MC泛基因组子图 坐标系转换 gfa 有路径信息和Node信息，有时候为了研究需要...
-
【基因组——天麻】天麻基因组揭露植物适应异养
Mycoheterotrophs（真菌异养型植物）：植物和真菌的共生大概开始于450百万年前。真菌异养是一种特殊的植物-真菌共生类型，植物从共生真菌获得固定碳和其他营养物质，...
-
利用单拷贝直系同源基因蛋白序列做分歧时间树
if [ -f "./env.sh" ]; then source ./env.sh else echo "env.sh file not in current direct...
-
有一个问题，就是orthofinder找到的单拷贝太少了，有木有什么方法把多拷贝种相似度最高的挑选出来作为单拷贝呢
比较基因组学分析1：构建单拷贝基因树
比较基因组学分析目录 1：单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间[https://www.jianshu.com/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收缩与扩张分析[ht...
-
根癌农杆菌介导转化的原理及应用农杆菌介导转化技术是指将目的基因插入到经过改造的T-DNA区，借助农杆菌的感染实现外源基因向植物细胞的转移与整合，然后通过细胞和组织培养技术，再生出转基因植株的技术。 Ti ...
-
查看p的基因有没有突变
1. RNAseq回帖到CDS序列 2. 2代数据回帖到基因组序列 将对应的cds/rna.bam和gene_genome.fa/gene_genome.bam拖入到geni...