@aa3a06a0be54 vxgzh：生命数据科学。回复关键词有相应的Rproject。最近毕业季，暂时不运营平台，抱歉
3.GEO的ID转换已经通关了如果不太清楚如何挖掘GEO数据库的，可以先看1. 四文搞定GEO数据库转录组差异分析之简介[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzk0MDI4M...
发简信
IP属地：河南
-
-
人类miRNA名称标准化数据库该数据库致力于收集、整理和提供规范化的miRNA命名信息，为学术界提供方便快捷的查询工具。通过使用这个数据库，研究者能够迅速找到所需的miRNA在不同数据库中的命名信息，避免...
-
是的嘞，很有道理，TCGA临床原始文件基本到2013年就停止更新了，但是GDC后面几年陆陆续续还有更新的随访数据，其实是不一样的
TCGA数据库 | 临床数据不仅仅只有clinical.tsv
其实经常分析TCGA数据库时会发现，clinical.tsv中基本没什么可用信息，大部分数据都是缺失的，那么，如何获取比较全面的临床数据，有哪些常用方法和数据库，一块来看看吧...
-
发不出来，得私信
KEGG数据库 | 通路结果分类展示
在做完KEGG通路富集之后，纷繁复杂的通路映入眼帘，略微有些杂乱无章，缺乏一个有序的排列，因此，本推送依据KEGG一级类目，将不同的通路归纳总结，分类排列，使结果更加规整，帮...
-
还在为毕业论文参考文献格式发愁吗，来试试批量国标（GB7714）引文数据库
好久不见， 最近一直没更新， 日更幻想破灭了， 不过还是很开心， 建库成功了 建库背景： 又逢一年毕业季， 每次引文都要一篇一篇复制粘贴去Pubmed或者谷歌学术上查， 再复...
-
Pubmed挖掘工具——提取数据库
手敲一篇推文，昨天搭了个数据库，主要用于存放和检索PubMed中出现过的数据库~ 地址： https://haoran-chen.shinyapps.io/Database_...
-
TCGA数据库 | 临床数据不仅仅只有clinical.tsv其实经常分析TCGA数据库时会发现，clinical.tsv中基本没什么可用信息，大部分数据都是缺失的，那么，如何获取比较全面的临床数据，有哪些常用方法和数据库，一块来看看吧...
-
STRINGdb | 交互式可视化蛋白网络互作
在STRING数据库中提交基因，获取PPI网络是比较常规的操作，包括下游使用cytoscape进行美化和hub网络的提取，但过程还是比较麻烦，本期介绍通过R语言来挖掘STRI...
-
-
GEOsampleDB——搞定大规模GEO检索时的样本筛选
在GEO检索时，总能见到一些奇怪命名的样本，这或许与测序时的脱敏相关，但这也给后续数据使用时的筛选带来不便，本期主要介绍一个数据库，能大大提高样本筛选时的效率 1. 拟解决的...
-
GO、KEGG、GSVA、GSEA | 多种富集方法该如何选择
我个人看法，不一定对哈，首先，GSEA和GSVA不是一回事，不能放在一起说。 GSVA主要是通过感兴趣的基因集来划分样本，有样本基因表达谱和一个感兴趣的基因集的情况下选GSV...
-
临床、生信发文都需要的Table 1
基线表显示了研究中包含的研究对象的特征。根据研究设计，它们可能有特定目的，但通常它们显示所包含的人群是否符合研究的资格标准。它们还表明结果可以推广到哪些人群。在病例对照研究中...
-
R，Python一块学，2023年可以考虑更新一下Rstudio了
前段时间，Rstudio宣布了更新，同时也改名成了Posit，功能更新的不多，但这个趋势确实给了我们一个提醒，同时对于有作图需求的小伙伴，我觉得还是很有帮助的~ 安装地址：h...