写在前面 做基因功能的人都会特别注意基因上有什么功能结构域，通常我们认为，结构域决定了这个基因的功能。随着高通量测序技术的发展，我们完全可以通过一级序列来预测该基因的结构域，...
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【HMMSCAN】使用pfam数据库对多序列文件进行结构域注释
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转座子（TE,散在重复）特征及其对基因组影响基因组中重复序列大体分为两类：串联重复（Tandem repeats，Tandem Duplication） （TRF可预测）散在重复（Dispersed repeats），...
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R数据可视化21:Edge Bundling图N久没有更新了，最近一段时间有点繁忙。今天，一起来学习一下一个和Circo图差不多的图：Edge Bunding图（不知道中文咋翻译）。其实在我看来都只是不同形式的网络图。 ...
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（RNA-seq工具比较）edgeR、limma、DESeq2三种差异表达包比较文章目录 加载R包和输入数据 表达数据整理3.edgeR包做差异表达4.limma包做差异表达5.DESeq2包做差异表达6.比较三种包差异表达基因筛选结果 1. 加载R包和...
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【R】clusterProfiler的GO/KEGG富集分析用法小结
前言 关于clusterProfiler这个R包就不介绍了，网红教授宣传得很成功，功能也比较强大，主要是做GO和KEGG的功能富集及其可视化。简单总结下用法，以后用时可直接找...
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简短介绍下如何用GCE确定GWAS阈值
GWAS大家都很熟悉了，随着目前越来越多的重测序文章的发表，可见如今SNP数据是非常的丰富，以及GWAS也发展了15年了，如今到了一个后GWAS时代。GWAS我也做了很多了，...
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html入门（二）选择器
选择器 要使用css对HTML页面中的元素实现一对一，一对多或者多对一的控制，这就需要用到CSS选择器。HTML页面中的元素就是通过CSS选择器进行控制的。 元素选择器作用：...
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群体分布——如何用R语言绘制群体地理分布Nathan写于2020.08.15群体的地理分布，是做文章经常放的第一张图，其表明你的群体材料在地理上分布的情况（感觉是一句废话） 01 input 首先输入数据是样品分组...
