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    ECNet

    一、安装ECNet (一)虚拟机使用极狐网站 引用链接: https://www.jianshu.com/p/8afdd5b48e56 [https://www.jiansh...

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    R语言上机操作1(数据集)

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  • 请问怎么用KEGGREST对一个具有geneID和KO注释信息的文件进行富集分析

    KEGGREST使用方法

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    Trimmomatic安装和用法

    一、安装 Trimmomatic是基于Java开发的,因此需要提前安装Java环境,才能使用Trimmomatic。安装Java环境可以参考我的简书:https://www....

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    细菌基因组拼接(一)

    2021.3.17持续更新中。。。 ⭐总纲 材料:Illumina双末端测序原始数据(通常是两个fastaq的.gz压缩文件,文中为:sequence_1.fastq.gz和...

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    细菌基因组拼接最终流程(三)

    2021.4.3持续更新中。。。目的:从Illumina原始下机数据拼接细菌基因组草图。软件:FastQC、Cutadapt、Velvet、SSPACE、gapfiller ...

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    Bcftools

    bcftools下载 进入bwa_test目录下,将bcf文件转换为variant.bcf格式 查看生成文件 将上述生成的variant.bcf文件转换为vcf文件类型 查看...

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    Bwa-bowtie2安装及运行

    apt-get安装bwa: 下载参考基因组 3. 运行bwa将read比对到参考基因组 bwa比对 打开比对文件 Bowtie2安装运行 拷贝参考基因组文件 建立索引 bow...

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    FastQC的安装和应用

    1、FastQC的安装 进入biosofts目录,下载fastqc安装包,wget 加安装包路径 将安装包文件解压缩 对FastQC增加执行权限,并查看安装情况 加入环境变量...

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    Conda的安装

    1、链接下载 1、在linux中输入命令 wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2021.05-Linux-x86...

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    SPAdes安装及运行

    SPAdes的安装: 源代码安装: 将文件夹解压缩到指定位置 进入文件所在目录查看安装情况 定义环境变量 在根目录下查看安装是否成功 SPAdes组装短序列基因组

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    Quast的安装以及运行

    Quast的安装 进入软件目录 测试软件是否可以运行 添加环境变量 用Quast分别对SPAdes和velvet的结果进行评价 查看python环境,若环境为3.8,则需切换...