配色来源于论文 https://www.nature.com/articles/s41577-022-00707-2[https://www.nature.com/artic...
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1. 什么是TCGA?TCGA中有哪些数据? TCGA的全称是The Cancer Genome Atlas, 这个项目始于2005年,它旨在使用基因测序和生物信息学编目与癌...
GEO数据库常用分析工具 GEO DataSets提供的分析工具 GEO2R GEO DataSets提供的分析工具 在GEO DataSets的详情界面有一个Data An...
GEO Database 近年来,利用高通量方法检测基因表达越来越普及,诸如微阵列杂交和基因表系列分析(SAGE)可以同时测量数以万计的基因转录脚本(gene transcr...
GEO 数据是生信技能树生信爆款入门课程[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247497973&i...
来自瑞士洛桑大学的研究人员通过全面的多组学分析,描述了脑肿瘤或胶质瘤,以及从肺、乳房和皮肤转移到大脑的肿瘤的免疫微环境图谱,为克服/支持肿瘤微环境(TME)特性以及利用TME...
因为目前合并多个测序、芯片数据集这一块并没有完全统一的标准,方法大概有五六种。公说公有理婆说婆有理,对于我这样的新手来说,最简单的是跟随顶级文章的文章思路或者分析流程和步骤。...
写在前面 其实很多作者已经探索的差不多了,相关脚本、教程也很多,但我还是自己系统的总结一下吧。有时候感觉是浪费时间,但是在写的时候能发现并学习到很多新的知识,不断记录反思,也...
1、巨噬细胞 巨噬细胞(Macrophage, M)是一类位于外周血,炎症组织中的白细胞。在动物体内主要通过吞噬细菌,死亡细胞及细胞残片等作用参与非特异性免疫调节(先天性免疫...
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Reveals Immune Cell Signatures in Alzhei...
signatureDB - B cell数据库CancerSEA - 癌症单细胞KIT(肾脏单细胞数据库):http://humphreyslab.com/SingleCel...
转录组(transcriptome),广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。转...
泛癌的基因表达量一般可以用TCGA和GTEx实现,但是肿瘤细胞系一般用CCLE临床生信之家[https://www.aclbi.com/static/index.html#/...
你不得不知道的GEO数据库芯片数据分析方法 大家好,我是阿琛。今天来给大家介绍一个新的专题内容---GEO数据库的使用方法。烹饪需要食材,分析需要数据。数据出发,整个研究的第...
Wang LC, Cui WY, Zhang Z, Tan ZL, Lv QL, Chen SH, Shen XL. Expression, methylation and ...