文中会对遇到的问题进行解答,图表部分也做了比较详细的说明,对初学者比较友好,当然知道实验部分会让你对数据如何得来的有一个整体的把握,知其然而知其所以然,分析和解释数据起来会更...
一、使用共享特征执行成对细胞匹配:在适当变换、归一化和批处理之后,对共享特证使用奇异值分解,基于简化矩阵的皮尔逊相关性构建跨数据距离矩阵。然后通过解决线性分配问题来发现初始细...
BSA定义 BSA:Bulked segregant analysis ,即混池分离分析,选择具有相对性状的亲本构建分离群体,选取表型极端的一定数量个体构建混池,基于两个混池...
1.创建python3.5环境、安装工具 conda create -n mutmap python=3.5 mutmap 2.准备文件 参考基因组(水稻):referenc...
Genome sequencing reveals agronomically important loci in rice using MutMap Abstract In...
全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。所以首先我们需要某个物种的全基因组序列和该物种的某个个体的基因组序列。...
使用GATK进行SNP和INDEL检测GATK是 Broad 开发的用于测序数据的变异检测软件,后续推广到动植物研究中,是目前最广泛使用的变异检测软件。GATK有两种方式变异...