我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程,并提供了基本的命令,用到的软件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等,在此分享出来...
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使用BRAKER2进行基因组注释 BRAKER2是一个基因组注释流程,能够组合GeneMark,AUGUSTUS和转录组数据。 在使用软件之前,有几点需要注意下 尽量提供高质...
大概是长期的不锻炼使得今天的爬山运动过量了,接着悲剧就是无法入眠。也幸亏明天是周日,干脆就起床码字了。总结下自己前面用snp构建系统进化树的方法吧。 1.构建进化树的算法 构...
刘小泽写于19.7.4-第二单元第五讲:重复平均表达量和变异系数相关性散点图 笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术课程链接在:...
在NGS分析入门阶段,我们不需要考虑太多的细节,只用知道一个分析的大致流程并完整跑下来即可。太多的细节,只会让我们对于分析产生莫须有的恐惧,因此一些“无关紧要“细节就被我们刻...
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