clusterProfiler是业界大神Y叔写的R包,看过了它的绘图就会使人沉迷于其颜值无法自拔。本文很多内容直接翻译自官方文档,加上了我的测试数据(还是以果蝇为例)。 一、...
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MOVICS包整合多组学数据进行分析,其安装的过程太让人心酸,大家安装的过程慢慢体会,下面就来学习下这个由“大鱼海棠”老师开发的R包吧。 1.示例数据 brca.tcga.R...
逻辑回归解决分类问题,第一步要先确定特征,自变量,因变量 用R 的glm,原始数据读入 read.csv()#第一行为列名,header=T,列名是各自变量 先分训练集和测试...
Glmnet主要用于拟合广义线性模型。筛选可以使loss达到最小的正则化参数lambda。该算法非常快,并且可以使用稀疏矩阵作为输入。主要有线性模型用于回归,logistic...
写在前面,有做广告的嫌疑,哈哈,2019.4刚发表的,不过貌似每发表之前引用率超高,貌似专门针对david,不过david真的过时了,这个网站也是直接输入基因列表,其他都不需...
基因集富集分析 (Gene Set Enrichment Analysis, GSEA) 的基本思想是使用预定义的基因集,通常来自功能注释或先前实验的结果,将基因按照在两类样...
一. 读取数据 因为我们一般自己录的数据都是excel表格的,对于读取excel,此处有一个小技巧 读取excel方法 1.把excel文件另存为CSV文件 2.按照读取cs...