如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候,大家得到的序列都是单个基因的长度,所以一般都是逐个基因的比较,用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方...
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最近发现了python版的MCScan,是个大宝藏。由于走了不少弯路,终于画出美图,赶紧记录下来。github地址 https://github.com/tanghaibao...
已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体,又如R包chromoMap,IdeoViz,karyploteR,ggbio和在线工具Idiographica,虽然能绘制直的...
移步 github 实现目录跳转,获得更好的阅读体验 目录 基因型填充1.1. 问题描述1.2. 技术来源的基因型缺失1.3. 缺失的判断:缺失率1.4. 基因型缺失的影响1...
#构建ref genome index file bwa index genome.fasta genome vim sam_file.sh#!/usr/bin/envbas...
《R语言入门》的读书笔记 本书的重点内容及感悟: 第一章 导言 1、R是一个有着统计分析功能及强大作图功能的软件系统。R内含了许多实用的统计分析及作图参数。作图参数能将产生的...
〇、序 Python是一种面向对象的解释型计算机程序设计语言,其使用,具有跨平台的特点,可以在Linux、macOS以及Windows系统中搭建环境并使用,其编写的代码在不同...
1 什么是R语言R语言是一个开源的数据分析环境,起初是由数位统计学家建立起来,以更好的进行统计计算和绘图,这篇wiki中包含了一些基本情况的介绍。由于R可以通过安装扩展包(P...
刘小泽写于18.7.18表型与基因型相关联(基因定位)是遗传学上的重要问题。 什么是重测序Resequencing? 我们使用的基因组是怎么来的?通过Denovo测序,也就是...