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  • 2020-10-28 最近折腾了一下Julia

    不要百度Julia,八成会有惊吓 我说的Julia是这个 - MIT 2012年推出的一门统计学语言[https://julialang.org]。我最开始对这东西不怎么感冒...

  • @JT_c781 肯定是能做的,112233表明的是不同的处理方式,他会评估11、22、33各自组内相同的或者相似的表达去做一个拟合。然后在做123之间的比较。

    edgeR的一些小九九

    基本上RNA-Seq等等各种测序手段都需要计算差异表达通常大家常用的软件不外乎cufflinks和几个R包DESeq、EBSeq、edgeR、ballgown。值得一提的是现...

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    Pyenv和pipenv

    上回说到,conda是个神奇的项目,能够解决许多依赖的问题。但是conda也有坑,我目前遇到的几个有 conda R不是原生R,是魔改R MRO项目。R本来底层就是C和C++...

  • Docker

    记Docker折腾出来的一点心得 前言 很久没有正经写笔记这些东西了,今天终于入了docker的门,就简单写一下 最近一直在写程序,我个人现在入了不少语言的门,所以在写东西的...

  • @YangKD_ 不行,edgeR只能算CPM,不过RPKM只是加了转录本的长度,自己手动算一下就好了

    edgeR的一些小九九

    基本上RNA-Seq等等各种测序手段都需要计算差异表达通常大家常用的软件不外乎cufflinks和几个R包DESeq、EBSeq、edgeR、ballgown。值得一提的是现...

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    conda简直神了[conda基本废了]

    2019.4.23conda是个商业化公司,所以没有授权不能随便建立其镜像。虽说说的是发邮件询问基本上就能够拿到授权,然而现实是国内的各大开源镜像站都拿不到。 没有国内镜像站...

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    BAM/SAM文件格式的一些小知识

    BAM/SAM文件的一些小知识 前言 如果不是在陈老师这读博,然后开始折腾BAM/SAM文件,我估计这辈子都不会了解到这么多东西吧 SAM/BAM简介 See Wiki Se...

  • MySQL折腾

    防止自己忘记怎么部署的了 一、安装 这台破服务器没有连外网,只能通过scp将本地的deb文件传上去然后再装。1 . 为了防止安装出现错误,首先完整清除mysql的痕迹 参考 ...

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    karyoploteR:画染色体的好帮手

    投稿在其他公众号里了,这份为作死测试用的,真的不是抄袭,,, karyoploteR official website(github) bioconductor github...

  • datatables折腾日志

    https://github.com/ygidtu/Flask-peewee-datatables上我挂了一个demo datatables:官网【https://datat...

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    edgeR的一些小九九

    基本上RNA-Seq等等各种测序手段都需要计算差异表达通常大家常用的软件不外乎cufflinks和几个R包DESeq、EBSeq、edgeR、ballgown。值得一提的是现...

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    拒播它的13家电视台,你们后悔吗

    前两天,Sir看到一则新闻。 不是什么特大的事,却很暖。 小伙子想轻生,拎着两瓶白酒,边喝边往江边走。 第二天,他却发现自己躺在公园凉亭,身边有一张字条和200元钱。 原来是...

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    Python折腾数据库(一)peewee

    SQL数据库恐怕没几个人能够绕过去,自己折腾跑分析也有几个年头了回头想想之前就是吃了没有充分利用数据库来管理数据的亏。 二的话,有缘再见,最近想学一下SQLAlchemy 先...

  • Linux的一些碎碎念

    Linux发行版 2017.8.1 我使用过的三种不同的发行版,也简单试用过另外几个发行版。配置使用环境的时候,为了满足自己的小需求涉及到许多坑,因此在此简单记录一下心得 一...