参考自知乎:https://zhuanlan.zhihu.com/p/20702684
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比对使用STAR 计算counts使用featureCounts 转化counts使用脚本 readsToTPM.pl $usage = "perl feartureCoun...
P-value 的计算方式 1) P-value 是 (在H0 = true的情况下)得到和试验数据一样极端(或更极端)的统计量的概率. 它不是H1发生的概率. 假定吃苹果的...
##Time:2017-10-8 ##Author:Feng Shengyu #-----------------------------------------------...
nohup STAR --runThreadN 10 --runMode genomeGenerate --genomeDir ./ --genomeFastaFiles ....
一、打开文件、保存、关闭文件(vi命令模式下使用) vi filename //打开filename文件 :w //保存文件 :w yusi123.com//保存...
引自jimmy大神 雪晴
sed -n '9p' filename #打印第9行 sed -n '9,19p' filename #打印第9-19行
du -h (disk usage -human) 查看当前目录下所有文件的大小(递归查询) -h 的意思是human,用人可以看懂的方式呈现 du -sh 查看当前目录中...
目的:通过GO富集分析,可以将差异表的的基因按照其功能进行归类,达到对基因进行注释和分类的目的。 富集的原理:enrich_factor-----( 某个term中出现的差异...
原理:WGCNA算法首先假定基因网络服从无尺度分布,并定义基因共表达相关矩阵、基因网络形成的邻接函数,然后计算不同节点的相异系数,并据此构建分层聚类树(,该聚类树的不同分支代...
查看物理CPU的个数 grep 'physical id' /proc/cpuinfo | sort -u 查看每个CPU上具有的核心数量 grep 'core id' /p...
下载所有的以gtf为后缀的文件: wget -c -r -np -nd -k -L -A “*gtf.gz”ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/gencod...
@EAS139:136:FC706VJ:2:2104:15343:197393 1:Y:18:ATCACG EAS139the unique instrument name ...
似乎是名额终于定下来了~~~终于可以解放一下下了 到底要去哪?难道我真的就这样放弃去北大,上交这种一流名校的机会,选择最开始的同济?到底是为什么?是什么吸引了我?我怕是中毒了...
使用的数据,双端测序数据clean data 1 &clean data 2 1、bowtie建库 bowtie2-build genome.fa genome_index ...
以后,我会把R语言中的一些各种作图的命令,整理一下,不断的在博客中更新,一方面,便于自己对知识的整理与积累,另一方面也希望和更多的朋友分享自己的知识,并希望可以结交更多...