请问在第五步gene = lapply(peakAnnoList, function(i) as.data.frame(i)$geneId) 和 ego<-enrichGO(gene = entrez, ..)之间的衔接是不是缺了一些步骤呀?想问一下大佬这里得到的gene是data.frame格式是么?需要怎么转换成entrez以供给后面一步使用呢~~
麻烦啦~~
第7篇:用Y叔的ChIPseeker对peaks进行注释和可视化上一步骤(第6篇:重复样本的处理——IDR)用IDR对重复样本peaks的一致性进行了评估,同时得到了merge后的一致性的peaks——sample-idr,接下来就是对p...