我要偷偷内卷，然后惊艳所有人！
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不看私信<br>看不到的文章是被简书锁了
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学习一遍ChIPseeker的使用刘小泽写于2020.5.23-24Y叔的原文在：https://mp.weixin.qq.com/s/3CMj0xejiV-FSMC-Vxd_-w 0 ChIPseeker的...
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不再更新
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记录和分享工作、科研上的技能和方法！在此之余，也希望能帮到有同样疑问的小伙伴！<br>微信公共号：YJY技能修炼<br>特别喜欢的一句话: 生如蝼蚁当立鸿鹄之志，命薄似纸应有不屈之心。
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努力努力再努力~<br>个人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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CUT&Tag数据分析笔记（1）前几天学习了文献CUT&Tag[https://www.jianshu.com/p/335aec753039]，了解了原理以后，可以跟着官网来学习如何分析CUT&Tag数据了...
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CUT&Tag数据分析笔记（2）在开始笔记之前我只想吐槽一下，官网里这一部分的代码错的离谱！！！各种报错报的我怀疑人生。。。 第四节 比对结果过滤和文件格式转换 （一）利用比对质量过滤比对上的【可选步骤】 ...
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CUT&Tag数据分析笔记（3）这是CUT&Tag数据分析的最后一部分，这一部分基本就是进行各种的可视化了。 第七节 可视化 通常，我们感兴趣的是使用基因组浏览器在各个区域可视化染色质landscape。I...
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list替换成immune_list
ssGSEA
一腔孤勇，携我至此；一把年纪，还是幼稚； Goals: 文献为《Local mutational diversity drives intratumoralimmune he...
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TCGA数据差异分析后生存分析（批量单因素cox回归/Lasso筛选，多因素cox建模，时间依赖ROC曲线及KM plot可视化）测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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生存分析和风险评估Log-rank批量生存分析Cox 批量生存分析作图 1、Kaplan-Meier生存分析——KM plot meta——临床信息表格 通过event和time就可以做出一张...
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Cox回归分析——森林图将Cox回归分析的结果提取出来，用森林图展示 step1 生成示例数据 生成的df数据框，如下图所示： 包含了病人ID，生存时间，结局事件和50个基因的表达数据。因为都是...
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TCGA文章复现——LncRNA-CRC预后Title:An Integrated Three-Long Non-coding RNA Signature Predicts Prognosis in Colorecta...
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中山大学中山医学院-基础医学博士在读<br>欢迎关注个人公众号<br><br>公众号：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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遗传学 博士研究生在读
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用 spike-in DNA 计算 BS 处理的转化率
WGBS 实验 BS 处理 C->U(T) 转化效率不是 100% 的，转化失败的部分 C 会成为假阳性信号，所以 BS 转化率也是很重要的指标。计算转化率需要建库实验参入已...
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生信工作者。
