这次只是对数据进行了初步的分析,下次有机会把完整分析过程跑下来😁
CUT-Tag分析CUT-Tag概述 所有发生在真核生物 DNA 上的动态过程都发生在染色质中,包括核小体及其修饰、转录因子和染色质相关复合物。各种染色质特征标记了活跃和沉默转录调控元件和染色...
这次只是对数据进行了初步的分析,下次有机会把完整分析过程跑下来😁
CUT-Tag分析CUT-Tag概述 所有发生在真核生物 DNA 上的动态过程都发生在染色质中,包括核小体及其修饰、转录因子和染色质相关复合物。各种染色质特征标记了活跃和沉默转录调控元件和染色...
CUT-Tag概述 所有发生在真核生物 DNA 上的动态过程都发生在染色质中,包括核小体及其修饰、转录因子和染色质相关复合物。各种染色质特征标记了活跃和沉默转录调控元件和染色...
根据标准分析流程中组装的所有转录本,生成所有可能的可变剪切事件;请问这样的话我是否可以用这些可变剪切事件对后面其他所有本物种转录组数据可变剪切进行分析呢?
SUPPA原理及结果解析SUPPA是一款强大的转录本或局部可变剪切分析工具,适用于有多个条件的可变剪切分析,具有灵活、高效及精准等特点。SUPPA具有很多操作模块,每个模块可以单独运行。SUPPA一...
一、数据读取 在利用R处理数据时,发现数据会有一些缺失,这时R就会报错 正如报错所示,第一行相比于其余行缺一个数据,这时我们可以利用 这个函数跳过第一行,但大多数据并不是仅仅...
在单细胞分析基本流程中,对单细胞簇命名之后发现此过程有些错误,想要重新命名该如何进行,以下代码可以重新将单细胞命名修改为原始分群数。
如何绘制下图所示的基因进化树 实例 以绵羊的NPPC基因为例绘制不同物种间的进化树1.首先利用NCBI查找NPPC的蛋白序列 2.利用NCBI网站对NPPC蛋白进行blast...
基因在结构上,分为编码区和非编码区两部分。真核生物的编码区是不连续的,分为外显子和内含子,在转录过程中会修剪内含子,并拼合外显子来形成转录产物。在原核生物中,基因是连续的,也...
@神经蛙_3abe 可以两两比较
单细胞不同组别进行差异基因分析大家做单细胞项目的时候,会涉及到多个组别,在分群之后想进行不同组别的差异基因分析,来查看不同处理对试验有什么影响。但生信小白只会流程化的分析,在对两组之间的单细胞进行差异分析...
下载aspera 软件官网:asperasoft.com 这一步推荐下载3.9.0以前的版本,我下载了最新的版本没有找到私钥,下载文件过程中会报错。 查看软件 1.软件下载至...
一、认识转录组 RNA作为基因组和蛋白质组之间的链接部分,是分子生物学中独特的核心活动。转录组测序是分析某一组织中的全部RNA的表达量,包括mRNA,rRNA,tRNA,ln...
fastq文件在经过fastqc文件质检后,一般都会生成一个网页版的文件,我们可以根据文件来分析我们的测序结果的好坏,前提是我们能够读懂这个文件中显示的内容,接下来我们主要解...
老师好,不同测序平台的数据可以整合嘛?
10X单细胞转录组多物种联合分析:以人和小鼠为例10X单细胞转录组是可以联合分析多个物种的。也许,你会问为什么要分析多个物种,我一个物种的某个器官还整明白呢?其实在做: 模型 移植 免疫 病毒 生殖隔离 的时候,同一个组织...
@小刘同学lls 是的
单细胞不同组别进行差异基因分析大家做单细胞项目的时候,会涉及到多个组别,在分群之后想进行不同组别的差异基因分析,来查看不同处理对试验有什么影响。但生信小白只会流程化的分析,在对两组之间的单细胞进行差异分析...
单细胞FeaturePlot图